特別行政區(qū)行政機關
特別行政區(qū)行政機關即特別行政區(qū)的政府。特別行政區(qū)行政長官為特別行政區(qū)政府首長。特別行政區(qū)政府下設政務司、財政司、律政司和各局、廳、處、署等。香港和澳門特別行政區(qū)政府的主要官員均由行政長官提名并報請中央人民政府任命，其免職也由行政長官向中央人民政府提出建議。
根據(jù)香港基本法第62條和澳門基本法第64條的規(guī)定，特別行政區(qū)政府行使下列主要職權(quán)：(1)制定并執(zhí)行政策;(2)管理各項行政事務;(3)辦理基本法規(guī)定的中央人民政府授權(quán)的對外事務;(4)編制并提出財政預算、決算;(5)擬定并提出法案、議案、附屬法規(guī);(6)委派官員列席立法會會議聽取意見或者代表政府發(fā)言。除此之外，特別行政區(qū)政府還依法管理境內(nèi)屬于國家所有的土地和自然資源;負責維持社會治安;自行制定貨幣金融政策并依法管理金融市場;經(jīng)中央人民政府授權(quán)管理民用航空運輸;經(jīng)中央人民政府授權(quán)在境內(nèi)簽發(fā)特別行政區(qū)護照和其他旅行證件;對出入境實行管制。
特別行政區(qū)行政長官
特別行政區(qū)行政長官是特別行政區(qū)的首長，代表特別行政區(qū)，根據(jù)基本法的規(guī)定，對中央人民政府和特別行政區(qū)負責。特別行政區(qū)行政長官由年滿40周歲，在香港通常居住連續(xù)滿20年并在外國無居留權(quán)的香港特別行政區(qū)永久性居民中的中國公民，或在澳門通常居住連續(xù)滿20年的澳門特別行政區(qū)永久性居民中的中國公民擔任?？梢?，除“年滿40周歲”、“連續(xù)居住滿20年”、“永久性居民中的中國公民”三個條件外，香港基本法比澳門基本法中的特首條件多一項：“在外國無居留權(quán)”。
關于特別行政區(qū)行政長官的產(chǎn)生辦法，基本法規(guī)定，在當?shù)赝ㄟ^選舉或協(xié)商產(chǎn)生，由中央人民政府任命。
根據(jù)香港基本法第45條的規(guī)定，香港特別行政區(qū)行政長官的產(chǎn)生辦法，應根據(jù)香港特別行政區(qū)的實際情況和循序漸進的原則而規(guī)定，最終達成由一個有廣泛代表性的提名委員會按民主程序提名后普選產(chǎn)生的目標。根據(jù)《香港特別行政區(qū)行政長官的產(chǎn)生辦法》的規(guī)定，在1997年到2007年的十年內(nèi)由800人組成的包括工商、金融界;勞工、社會服務、宗教界;立法會議員、區(qū)域性組織代表以及香港地區(qū)全國人大代表和全國政協(xié)委員的代表等各界人士在內(nèi)的、具有廣泛代表性的選舉委員會選舉產(chǎn)生，由中央人民政府任命。
2007年12月29日，第十屆全國人大常委會第三十一次會議通過《關于香港特別行政區(qū)2012年行政長官和立法會產(chǎn)生辦法及有關普選問題的決定》。根據(jù)這一決定，2012年香港特別行政區(qū)第四任行政長官的選舉，不實行由普選產(chǎn)生的辦法。2012年香港特別行政區(qū)第五屆立法會的選舉，不實行全部議員由普選產(chǎn)生的辦法。2017年香港特別行政區(qū)第五任行政長官的選舉可以實行由普選產(chǎn)生的辦法;在行政長官由普選產(chǎn)生后，香港特別行政區(qū)立法會的選舉可以實行全部議員由普選產(chǎn)生的辦法：
澳門特別行政區(qū)行政長官的產(chǎn)生辦法與香港基本相同，但澳門特別行政區(qū)沒有關于“根據(jù)循序漸進的原則，最終達到由普選產(chǎn)生”的規(guī)定;其選舉委員會和推選委員會的人數(shù)比香港少得多。從1999年12月20日到2009年期間的第一、第二、第三任行政長官分別按照《全國人民代表大會關于澳門特別行政區(qū)第一屆政府、立法會和司法機關產(chǎn)生辦法的決定》和《澳門特別行政區(qū)行政長官產(chǎn)生辦法》產(chǎn)生。
香港特別行政區(qū)和澳門特別行政區(qū)的行政長官任期為5年，均可以連選連任一次。