全額事業(yè)單位和差額事業(yè)單位兩者都不錯，關鍵是所在單位，想干什么工作等等，沒有一定的可比性。
全額撥款事業(yè)單位也稱為全供事業(yè)單位，也就是全額預算管理的事業(yè)單位，是其所需的事業(yè)經(jīng)費全部由國家預算撥款的一種管理形式。這種管理形式，一般適用于沒有收入或收入不穩(wěn)定的事業(yè)單位;如學校、科研單位、衛(wèi)生防疫、工商管理等事業(yè)單位，即人員費用、公用費用都要由國家財政提供。采用這種管理形式，有利于國家對事業(yè)單位的收入進行全面的管理和監(jiān)督，同時使事業(yè)單位的經(jīng)費得到充分的保證。
差額預算管理的事業(yè)單位即對有經(jīng)常、穩(wěn)定業(yè)務收入的單位，采取全面核算、收支掛鉤、以收抵支的管理形式。既按定員定額指標核定的單位年度經(jīng)費預算總額與單位創(chuàng)造的收入之比，支大于收的差額部分由國家預算補助，收大于支的部分上交國家財政。也可以說差額是按基數(shù)加增長的方式由財政負擔，也就是財政給一部分，剩下的單位要自收自支的。