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保稅區(qū)內(nèi)的企業(yè)辦理報檢手續(xù)前，應(yīng)辦理備案或注冊登記手續(xù)。
如果從事加工、儲存出境食品的企業(yè)還應(yīng)辦理出境食品生產(chǎn)企業(yè)衛(wèi)生注冊登記手續(xù)。
1、輸入保稅區(qū)的法定檢驗檢疫對象的檢驗檢疫
（1）從境外進(jìn)入保稅區(qū)的法定檢驗檢疫對象，屬于衛(wèi)生和動植物檢疫范圍的，事實衛(wèi)生和動植物檢疫。應(yīng)當(dāng)實施衛(wèi)生和動植物檢疫除害處理的，由檢驗檢疫機(jī)構(gòu)進(jìn)行衛(wèi)生除害處理。
（2）對從境外進(jìn)入保稅區(qū)可以用作原材料的固體廢物、舊機(jī)電產(chǎn)品、成套設(shè)備實施檢驗和監(jiān)管；對外商投資財產(chǎn)按照有關(guān)規(guī)定進(jìn)行價值鑒定，對未辦理手續(xù)的貨物不實施檢驗。
（3）保稅區(qū)內(nèi)企業(yè)從境外進(jìn)入保稅區(qū)的倉儲物流貨物以及自用的辦公用品，出口加工所需原材料、零部件，免予實施強(qiáng)制性產(chǎn)品認(rèn)證。
（4）從我國非保稅區(qū)進(jìn)入保稅區(qū)時，不需要辦理手續(xù)，檢驗檢疫機(jī)構(gòu)不實施檢驗檢疫。
2、輸出保稅區(qū)的法定檢驗檢疫對象的檢驗檢疫
（1）從保稅區(qū)輸往境外的法定檢驗檢疫對象，檢驗檢疫機(jī)構(gòu)依法實施檢驗檢疫
入境時已經(jīng)實施檢驗的保稅區(qū)內(nèi)的貨物輸往非保稅區(qū)的，以及從非保稅區(qū)進(jìn)入保稅區(qū)的貨物又輸往非保稅區(qū)的，不實施檢驗。
（2）從保稅區(qū)輸往非保稅區(qū)的法定檢驗檢疫對象，除法律法規(guī)另有規(guī)定的，不實施檢疫。屬于實施食品衛(wèi)生監(jiān)督檢驗范圍的，檢驗檢疫機(jī)構(gòu)實施檢驗；
對集中入境分批出區(qū)的貨物，可以分批報檢、分批檢驗；符合條件的，可以于入境時集中報檢，集中檢驗，經(jīng)檢驗合格的出區(qū)時分批核銷。
（3）從保稅區(qū)輸往非保稅區(qū)的法定檢驗檢疫對象，列入強(qiáng)制性產(chǎn)品認(rèn)證目錄的，應(yīng)當(dāng)提供相應(yīng)的認(rèn)證證書，其產(chǎn)品上應(yīng)當(dāng)加帖強(qiáng)制性產(chǎn)品認(rèn)證標(biāo)志；預(yù)包裝食品和化妝品，應(yīng)當(dāng)向檢驗檢疫機(jī)構(gòu)申請辦理標(biāo)簽審核手續(xù)。
（4）從非保稅區(qū)進(jìn)入保稅區(qū)后不經(jīng)加工直接出境的，保稅區(qū)檢驗檢疫機(jī)構(gòu)憑產(chǎn)地檢驗檢疫簽發(fā)的《出境貨物換證憑單》或“換證憑條”換證放行，不再實施檢驗檢疫。如需要重新報檢的，應(yīng)按規(guī)定重新報檢。
（5）保稅區(qū)內(nèi)企業(yè)加工出境產(chǎn)品，符合有關(guān)規(guī)定的，可以向檢驗檢疫機(jī)構(gòu)申請簽發(fā)原產(chǎn)地證書。
保稅區(qū)內(nèi)的企業(yè)辦理報檢手續(xù)前，應(yīng)辦理備案或注冊登記手續(xù)。
如果從事加工、儲存出境食品的企業(yè)還應(yīng)辦理出境食品生產(chǎn)企業(yè)衛(wèi)生注冊登記手續(xù)。
1、輸入保稅區(qū)的法定檢驗檢疫對象的檢驗檢疫
（1）從境外進(jìn)入保稅區(qū)的法定檢驗檢疫對象，屬于衛(wèi)生和動植物檢疫范圍的，事實衛(wèi)生和動植物檢疫。應(yīng)當(dāng)實施衛(wèi)生和動植物檢疫除害處理的，由檢驗檢疫機(jī)構(gòu)進(jìn)行衛(wèi)生除害處理。
（2）對從境外進(jìn)入保稅區(qū)可以用作原材料的固體廢物、舊機(jī)電產(chǎn)品、成套設(shè)備實施檢驗和監(jiān)管；對外商投資財產(chǎn)按照有關(guān)規(guī)定進(jìn)行價值鑒定，對未辦理手續(xù)的貨物不實施檢驗。
（3）保稅區(qū)內(nèi)企業(yè)從境外進(jìn)入保稅區(qū)的倉儲物流貨物以及自用的辦公用品，出口加工所需原材料、零部件，免予實施強(qiáng)制性產(chǎn)品認(rèn)證。
（4）從我國非保稅區(qū)進(jìn)入保稅區(qū)時，不需要辦理手續(xù)，檢驗檢疫機(jī)構(gòu)不實施檢驗檢疫。
2、輸出保稅區(qū)的法定檢驗檢疫對象的檢驗檢疫
（1）從保稅區(qū)輸往境外的法定檢驗檢疫對象，檢驗檢疫機(jī)構(gòu)依法實施檢驗檢疫
入境時已經(jīng)實施檢驗的保稅區(qū)內(nèi)的貨物輸往非保稅區(qū)的，以及從非保稅區(qū)進(jìn)入保稅區(qū)的貨物又輸往非保稅區(qū)的，不實施檢驗。
（2）從保稅區(qū)輸往非保稅區(qū)的法定檢驗檢疫對象，除法律法規(guī)另有規(guī)定的，不實施檢疫。屬于實施食品衛(wèi)生監(jiān)督檢驗范圍的，檢驗檢疫機(jī)構(gòu)實施檢驗；
對集中入境分批出區(qū)的貨物，可以分批報檢、分批檢驗；符合條件的，可以于入境時集中報檢，集中檢驗，經(jīng)檢驗合格的出區(qū)時分批核銷。
（3）從保稅區(qū)輸往非保稅區(qū)的法定檢驗檢疫對象，列入強(qiáng)制性產(chǎn)品認(rèn)證目錄的，應(yīng)當(dāng)提供相應(yīng)的認(rèn)證證書，其產(chǎn)品上應(yīng)當(dāng)加帖強(qiáng)制性產(chǎn)品認(rèn)證標(biāo)志；預(yù)包裝食品和化妝品，應(yīng)當(dāng)向檢驗檢疫機(jī)構(gòu)申請辦理標(biāo)簽審核手續(xù)。
（4）從非保稅區(qū)進(jìn)入保稅區(qū)后不經(jīng)加工直接出境的，保稅區(qū)檢驗檢疫機(jī)構(gòu)憑產(chǎn)地檢驗檢疫簽發(fā)的《出境貨物換證憑單》或“換證憑條”換證放行，不再實施檢驗檢疫。如需要重新報檢的，應(yīng)按規(guī)定重新報檢。
（5）保稅區(qū)內(nèi)企業(yè)加工出境產(chǎn)品，符合有關(guān)規(guī)定的，可以向檢驗檢疫機(jī)構(gòu)申請簽發(fā)原產(chǎn)地證書。