黃酮類(lèi)化合物多為結(jié)晶性固體，少數(shù)（如黃酮苷類(lèi)）為無(wú)定形粉末。黃酮類(lèi)化合物的顏色與分子中是否有交叉共軛體系及助色團(tuán)（-OH、-OCH3等）的種類(lèi)、數(shù)目、取代位置有關(guān)。以黃酮為例來(lái)說(shuō)，其色原酮部分原本是無(wú)色的，但在2-位上引入苯環(huán)后，即形成了交叉共軛體系，使共軛鏈延長(zhǎng)，因而顯現(xiàn)出顏色。一般情況下，黃酮、黃酮醇及其苷類(lèi)多顯灰黃～黃色，查耳酮為黃～橙黃色，而二氫黃酮、二氫黃酮醇、異黃酮類(lèi)，因不具有交叉共軛體系或共軛鏈較短，故不顯色（二氫黃酮及二氫黃酮醇）或顯淺黃色（異黃酮）。