建設項目竣工環(huán)境保護驗收的基本程序是：建設項目竣工后需要進行試生產(chǎn)或試運行的建設項目首先向環(huán)境保護行政主管部門申請試生產(chǎn)、試運行；在試生產(chǎn)、試運行期間，建設單位應當對環(huán)境保護設施運行情況和建設項目對環(huán)境的影響進行監(jiān)測，并向環(huán)境保護行政主管部門提出竣工環(huán)境保護驗收申請，委托有資質(zhì)的服務機構進行環(huán)境保護驗收監(jiān)測或驗收調(diào)查；申請材料齊備、環(huán)境保護行政主管部門受理后，將在規(guī)定的期限內(nèi)組成驗收組或驗收委員會進行現(xiàn)場檢查和審議，提出驗收意見并完成審批。
1．試生產(chǎn)的申請和審查
《建設項目竣工環(huán)境保護驗收管理辦法》規(guī)定：建設項目試生產(chǎn)前，建設單位應向有審批權的環(huán)境保護行政主管部門提出試生產(chǎn)申請。對國務院環(huán)境保護行政主管部門審批環(huán)境影響報告書（表）或環(huán)境影響登記表的非核設施建設項目，由建設項目所在地省、自治區(qū)、直轄市人民政府環(huán)境保護行政主管部門負責受理其試生產(chǎn)申請，并將其審查決定報送國務院環(huán)境保護行政主管部門備案。核設施建設項目試運行前，建設單位應向國務院環(huán)境保護行政主管部門報批首次裝料階段的環(huán)境影響報告書，經(jīng)批準后，方可進行試運行。
同時還規(guī)定：環(huán)境保護行政主管部門應自接到試生產(chǎn)申請之日起30日內(nèi)，組織或委托下一級環(huán)境保護行政主管部門對申請試生產(chǎn)的建設項目環(huán)境保護設施及其他環(huán)境保護措施的落實情況進行現(xiàn)場檢查，并做出審查決定。對環(huán)境保護設施已建成及其他環(huán)境保護措施已按規(guī)定要求落實的，同意試生產(chǎn)申請；對環(huán)境保護設施或其他環(huán)境保護措施未按規(guī)定建成或落實的，不予同意，并說明理由。逾期未做出決定的，視為同意。試生產(chǎn)申請經(jīng)環(huán)境保護行政主管部門同意后，建設單位方可進行試生產(chǎn)。
試生產(chǎn)期間，建設單位應盡環(huán)境監(jiān)測的義務?！督ㄔO項目環(huán)境保護管理條例》第十九條規(guī)定：
建設項目試生產(chǎn)期間，建設單位應當對環(huán)境保護設施運行情況和建設項目對環(huán)境的影響進行監(jiān)測。
2．環(huán)境保護驗收申請
建設項目竣工后，建設單位應當向有審批權的環(huán)境保護行政主管部門，申請該建設項目竣工環(huán)境保護驗收。進行試生產(chǎn)的建設項目，建設單位應當自試生產(chǎn)之日起3個月內(nèi)，向有審批權的環(huán)境保護行政主管部門申請該建設項目竣工環(huán)境保護驗收。
建設單位除向有審批權的環(huán)境保護行政主管部門提交建設項目竣工環(huán)境保護驗收申請報告外，還應根據(jù)分類管理的要求，附環(huán)境保護驗收監(jiān)測報告、調(diào)查報告（表）或驗收登記卡，以及其他有關材料。
對主要因排放污染物對環(huán)境產(chǎn)生污染和危害的建設項目，建設單位應提交環(huán)鏡保護驗收監(jiān)測報告（表）。對主要對生態(tài)環(huán)境產(chǎn)生影響的建設項目，建設單位應提交環(huán)境保護驗收調(diào)查報告（表）。
環(huán)境保護驗收監(jiān)測報告（表），由建設單位委托經(jīng)環(huán)境保護征政主管部門批準有相應資質(zhì)的環(huán)境監(jiān)測站或環(huán)境放射性監(jiān)測站編制。環(huán)境保護驗收調(diào)查報告（表）由建設單位委托經(jīng)環(huán)境保護行政主管部門批準有相應資質(zhì)的環(huán)境監(jiān)測站或環(huán)境放射性監(jiān)測站，或者具有相應資質(zhì)的環(huán)境影響評價單位編制。
3．環(huán)境保護驗收及批準
環(huán)境保護行政主管部門應當自收到建設項目竣工環(huán)境保護驗收申請之日起30日內(nèi)，完成驗收。
環(huán)境保護行政主管部門在進行建設項目竣工環(huán)境保護驗收時，應組織建設項目所在地的環(huán)境保護行政主管部門和行業(yè)主管部門等成立驗收組（或驗收委員會）習驗收組（或驗收委員會）應對建設項目的環(huán)境保護設施及其他環(huán)境保護措施進行現(xiàn)場檢查和審議，提出驗收意見。建設項目的建設單位、設計單位、施工單位、環(huán)境影響報告書（表）編制單位、環(huán)境保護驗收監(jiān)測（調(diào)查）報告（表）的編制單位應當參與驗收。
對符合規(guī)定驗收條件的建設項目，環(huán)境保護行政主管部門批準“建設項目竣工環(huán)境保護驗收申請報告”、“建設項目竣工環(huán)境保護驗收申請表”或“建設項目竣工環(huán)境保護驗收登記卡”。對填報“建設項目竣工環(huán)境保護驗收登記卡”的建設項目，環(huán)境保護行政主管部門經(jīng)過核查后，可直接在“建設項目竣工環(huán)境保護驗收登記卡”上簽署驗收意見，作出批準決定。
“建設項目竣工環(huán)境保護驗收申請報告”、“建設項目竣工環(huán)境保護驗收申請表”或者“建設項目竣工環(huán)境保護驗收登記卡”未經(jīng)批準的建設項目，不得正式投入生產(chǎn)或者使用。
環(huán)境保護部建設項目竣工環(huán)境保護驗收具體工作流程圖
1．試生產(chǎn)的申請和審查
《建設項目竣工環(huán)境保護驗收管理辦法》規(guī)定：建設項目試生產(chǎn)前，建設單位應向有審批權的環(huán)境保護行政主管部門提出試生產(chǎn)申請。對國務院環(huán)境保護行政主管部門審批環(huán)境影響報告書（表）或環(huán)境影響登記表的非核設施建設項目，由建設項目所在地省、自治區(qū)、直轄市人民政府環(huán)境保護行政主管部門負責受理其試生產(chǎn)申請，并將其審查決定報送國務院環(huán)境保護行政主管部門備案。核設施建設項目試運行前，建設單位應向國務院環(huán)境保護行政主管部門報批首次裝料階段的環(huán)境影響報告書，經(jīng)批準后，方可進行試運行。
同時還規(guī)定：環(huán)境保護行政主管部門應自接到試生產(chǎn)申請之日起30日內(nèi)，組織或委托下一級環(huán)境保護行政主管部門對申請試生產(chǎn)的建設項目環(huán)境保護設施及其他環(huán)境保護措施的落實情況進行現(xiàn)場檢查，并做出審查決定。對環(huán)境保護設施已建成及其他環(huán)境保護措施已按規(guī)定要求落實的，同意試生產(chǎn)申請；對環(huán)境保護設施或其他環(huán)境保護措施未按規(guī)定建成或落實的，不予同意，并說明理由。逾期未做出決定的，視為同意。試生產(chǎn)申請經(jīng)環(huán)境保護行政主管部門同意后，建設單位方可進行試生產(chǎn)。
試生產(chǎn)期間，建設單位應盡環(huán)境監(jiān)測的義務?！督ㄔO項目環(huán)境保護管理條例》第十九條規(guī)定：
建設項目試生產(chǎn)期間，建設單位應當對環(huán)境保護設施運行情況和建設項目對環(huán)境的影響進行監(jiān)測。
2．環(huán)境保護驗收申請
建設項目竣工后，建設單位應當向有審批權的環(huán)境保護行政主管部門，申請該建設項目竣工環(huán)境保護驗收。進行試生產(chǎn)的建設項目，建設單位應當自試生產(chǎn)之日起3個月內(nèi)，向有審批權的環(huán)境保護行政主管部門申請該建設項目竣工環(huán)境保護驗收。
建設單位除向有審批權的環(huán)境保護行政主管部門提交建設項目竣工環(huán)境保護驗收申請報告外，還應根據(jù)分類管理的要求，附環(huán)境保護驗收監(jiān)測報告、調(diào)查報告（表）或驗收登記卡，以及其他有關材料。
對主要因排放污染物對環(huán)境產(chǎn)生污染和危害的建設項目，建設單位應提交環(huán)鏡保護驗收監(jiān)測報告（表）。對主要對生態(tài)環(huán)境產(chǎn)生影響的建設項目，建設單位應提交環(huán)境保護驗收調(diào)查報告（表）。
環(huán)境保護驗收監(jiān)測報告（表），由建設單位委托經(jīng)環(huán)境保護征政主管部門批準有相應資質(zhì)的環(huán)境監(jiān)測站或環(huán)境放射性監(jiān)測站編制。環(huán)境保護驗收調(diào)查報告（表）由建設單位委托經(jīng)環(huán)境保護行政主管部門批準有相應資質(zhì)的環(huán)境監(jiān)測站或環(huán)境放射性監(jiān)測站，或者具有相應資質(zhì)的環(huán)境影響評價單位編制。
3．環(huán)境保護驗收及批準
環(huán)境保護行政主管部門應當自收到建設項目竣工環(huán)境保護驗收申請之日起30日內(nèi)，完成驗收。
環(huán)境保護行政主管部門在進行建設項目竣工環(huán)境保護驗收時，應組織建設項目所在地的環(huán)境保護行政主管部門和行業(yè)主管部門等成立驗收組（或驗收委員會）習驗收組（或驗收委員會）應對建設項目的環(huán)境保護設施及其他環(huán)境保護措施進行現(xiàn)場檢查和審議，提出驗收意見。建設項目的建設單位、設計單位、施工單位、環(huán)境影響報告書（表）編制單位、環(huán)境保護驗收監(jiān)測（調(diào)查）報告（表）的編制單位應當參與驗收。
對符合規(guī)定驗收條件的建設項目，環(huán)境保護行政主管部門批準“建設項目竣工環(huán)境保護驗收申請報告”、“建設項目竣工環(huán)境保護驗收申請表”或“建設項目竣工環(huán)境保護驗收登記卡”。對填報“建設項目竣工環(huán)境保護驗收登記卡”的建設項目，環(huán)境保護行政主管部門經(jīng)過核查后，可直接在“建設項目竣工環(huán)境保護驗收登記卡”上簽署驗收意見，作出批準決定。
“建設項目竣工環(huán)境保護驗收申請報告”、“建設項目竣工環(huán)境保護驗收申請表”或者“建設項目竣工環(huán)境保護驗收登記卡”未經(jīng)批準的建設項目，不得正式投入生產(chǎn)或者使用。
環(huán)境保護部建設項目竣工環(huán)境保護驗收具體工作流程圖