1999年12月25日九屆全國人大常委會第十三次會議審議通過了修訂的《中華人民共和國海洋環(huán)境保護法》（以下簡稱“新法”），這部法律將于2000年4月1日起施行?，F(xiàn)行的海洋環(huán)境保護法（以下簡稱“現(xiàn)行法”）是于1982年8月23日由五屆全國人大常委會第二十四次會議審議通過，自1983年3月1日起施行的。全國人大環(huán)境與資源保護委員會于1995年起著手研究這部法律的修改工作，在1999年6月在九屆全國人大常委會第十次會議上提出了海洋環(huán)境保護法的修訂草案。
修訂后的海洋環(huán)境保護法包括總則、海洋環(huán)境監(jiān)督管理、海洋生態(tài)保護、防治陸源污染物對海洋環(huán)境的污染損害、防治海岸工程建設(shè)項目對海洋環(huán)境的污染損害、防治海洋工程建設(shè)項目對海洋環(huán)境的污染損害、防治傾倒廢棄物對海洋環(huán)境的污染損害、法律責(zé)任、附則等共十章九十八條，對現(xiàn)行法作了較大的修改。修改的主要內(nèi)容有以下幾個方面：
1．為強化海洋環(huán)境管理，增加了“海洋環(huán)境監(jiān)督管理”一章。新法根據(jù)憲法以及政府機構(gòu)改革方案對各部門職責(zé)分工的規(guī)定，進一步明確了國務(wù)院環(huán)境保護行政主管部門以及海洋、海事、漁政等主管部門之間的職責(zé)分工：在由國務(wù)院環(huán)境保護行政主管部門對全國環(huán)境保護工作統(tǒng)一監(jiān)督管理和對海洋環(huán)境工作指導(dǎo)、協(xié)調(diào)、監(jiān)督的前提下，各有關(guān)部門根據(jù)各自的職責(zé)負(fù)責(zé)相關(guān)的海洋環(huán)境監(jiān)督管理工作，在必要時行使海洋環(huán)境監(jiān)督管理權(quán)的部門還可以在海上實行聯(lián)合執(zhí)法；同時為發(fā)揮海洋行政主管部門的科技優(yōu)勢，保證科技成果向管理手段轉(zhuǎn)化，增加了其相應(yīng)的管理職責(zé)。
2．新法在現(xiàn)行法和國務(wù)院及有關(guān)部門制定的行政法規(guī)和規(guī)章中確定的有關(guān)海洋環(huán)境保護制度的基礎(chǔ)上，增加和完善了海洋環(huán)境保護法律制度，包括：重點海域污染物總量控制制度、海洋污染事故應(yīng)急制度、船舶油污損害民事賠償制度和船舶油污保險制度、“三同時”制度、對嚴(yán)重污染海洋環(huán)境的落后工藝和落后設(shè)備的淘汰制度、排污收費制度，以及申報制度、現(xiàn)場檢查制度、限期治理制度、環(huán)境影響評價制度、海洋環(huán)境污染損害民事賠償制度、行政法律責(zé)任制度等。
3．增設(shè)“海洋生態(tài)保護”一章。保護海洋生態(tài)與保護海洋環(huán)境是密不可分的，新法增加了“海洋生態(tài)保護”一章，對保護海洋生態(tài)提出了適當(dāng)?shù)囊?，明確規(guī)定沿海地方各級政府必須對本行政區(qū)域近岸海域海洋生態(tài)狀況負(fù)責(zé)；對具有重要經(jīng)濟、社會價值，巳遭到破壞的海洋生態(tài)應(yīng)當(dāng)進行整治；建立了海洋自然保護區(qū)和海洋特別保護區(qū)制度；對開發(fā)利用海洋和海島的行為提出了保護生態(tài)的要求。
4．將現(xiàn)行法“防止海洋石油勘探開發(fā)對海洋環(huán)境的污染損害”一章擴充為“防治海洋工程建設(shè)工目對海洋環(huán)境的污染損害”一章，將各種類型的海洋工程建設(shè)對海洋環(huán)境污染的防治納入法律規(guī)范，包括海洋石油勘探開發(fā)、建設(shè)海底隧道、鋪設(shè)海底電纜、建設(shè)人工島、在海岸線以下進行圍海工程等。
5．強化了海洋污染損害的法律責(zé)任。新法的“法律責(zé)任”一章由現(xiàn)行法的4條規(guī)定擴充為25條，第一，增加了行政強制措施和行政處罰手段，在現(xiàn)行法“限期治理、繳納排污費、支付消除污染費用，以及警告和罰款”等五項的基礎(chǔ)上，增加了“責(zé)令采取補救措施、沒收違法所得、限期拆除、責(zé)令停止生產(chǎn)或者使用、責(zé)令停業(yè)或者關(guān)閉、暫扣或者吊銷許可證等；第二，強化了對破壞海洋生態(tài)系統(tǒng)行為的處罰；第三，強化了對污染破壞海洋環(huán)境行為的民事賠償責(zé)任，特別是明確了有關(guān)部門可以代表國家向污染海洋環(huán)境的責(zé)任人提出賠償損失的要求。
修訂后的海洋環(huán)境保護法包括總則、海洋環(huán)境監(jiān)督管理、海洋生態(tài)保護、防治陸源污染物對海洋環(huán)境的污染損害、防治海岸工程建設(shè)項目對海洋環(huán)境的污染損害、防治海洋工程建設(shè)項目對海洋環(huán)境的污染損害、防治傾倒廢棄物對海洋環(huán)境的污染損害、法律責(zé)任、附則等共十章九十八條，對現(xiàn)行法作了較大的修改。修改的主要內(nèi)容有以下幾個方面：
1．為強化海洋環(huán)境管理，增加了“海洋環(huán)境監(jiān)督管理”一章。新法根據(jù)憲法以及政府機構(gòu)改革方案對各部門職責(zé)分工的規(guī)定，進一步明確了國務(wù)院環(huán)境保護行政主管部門以及海洋、海事、漁政等主管部門之間的職責(zé)分工：在由國務(wù)院環(huán)境保護行政主管部門對全國環(huán)境保護工作統(tǒng)一監(jiān)督管理和對海洋環(huán)境工作指導(dǎo)、協(xié)調(diào)、監(jiān)督的前提下，各有關(guān)部門根據(jù)各自的職責(zé)負(fù)責(zé)相關(guān)的海洋環(huán)境監(jiān)督管理工作，在必要時行使海洋環(huán)境監(jiān)督管理權(quán)的部門還可以在海上實行聯(lián)合執(zhí)法；同時為發(fā)揮海洋行政主管部門的科技優(yōu)勢，保證科技成果向管理手段轉(zhuǎn)化，增加了其相應(yīng)的管理職責(zé)。
2．新法在現(xiàn)行法和國務(wù)院及有關(guān)部門制定的行政法規(guī)和規(guī)章中確定的有關(guān)海洋環(huán)境保護制度的基礎(chǔ)上，增加和完善了海洋環(huán)境保護法律制度，包括：重點海域污染物總量控制制度、海洋污染事故應(yīng)急制度、船舶油污損害民事賠償制度和船舶油污保險制度、“三同時”制度、對嚴(yán)重污染海洋環(huán)境的落后工藝和落后設(shè)備的淘汰制度、排污收費制度，以及申報制度、現(xiàn)場檢查制度、限期治理制度、環(huán)境影響評價制度、海洋環(huán)境污染損害民事賠償制度、行政法律責(zé)任制度等。
3．增設(shè)“海洋生態(tài)保護”一章。保護海洋生態(tài)與保護海洋環(huán)境是密不可分的，新法增加了“海洋生態(tài)保護”一章，對保護海洋生態(tài)提出了適當(dāng)?shù)囊?，明確規(guī)定沿海地方各級政府必須對本行政區(qū)域近岸海域海洋生態(tài)狀況負(fù)責(zé)；對具有重要經(jīng)濟、社會價值，巳遭到破壞的海洋生態(tài)應(yīng)當(dāng)進行整治；建立了海洋自然保護區(qū)和海洋特別保護區(qū)制度；對開發(fā)利用海洋和海島的行為提出了保護生態(tài)的要求。
4．將現(xiàn)行法“防止海洋石油勘探開發(fā)對海洋環(huán)境的污染損害”一章擴充為“防治海洋工程建設(shè)工目對海洋環(huán)境的污染損害”一章，將各種類型的海洋工程建設(shè)對海洋環(huán)境污染的防治納入法律規(guī)范，包括海洋石油勘探開發(fā)、建設(shè)海底隧道、鋪設(shè)海底電纜、建設(shè)人工島、在海岸線以下進行圍海工程等。
5．強化了海洋污染損害的法律責(zé)任。新法的“法律責(zé)任”一章由現(xiàn)行法的4條規(guī)定擴充為25條，第一，增加了行政強制措施和行政處罰手段，在現(xiàn)行法“限期治理、繳納排污費、支付消除污染費用，以及警告和罰款”等五項的基礎(chǔ)上，增加了“責(zé)令采取補救措施、沒收違法所得、限期拆除、責(zé)令停止生產(chǎn)或者使用、責(zé)令停業(yè)或者關(guān)閉、暫扣或者吊銷許可證等；第二，強化了對破壞海洋生態(tài)系統(tǒng)行為的處罰；第三，強化了對污染破壞海洋環(huán)境行為的民事賠償責(zé)任，特別是明確了有關(guān)部門可以代表國家向污染海洋環(huán)境的責(zé)任人提出賠償損失的要求。