在我國現有的國家大氣污染物排放標準體系中，按照綜合性排放標準與行業(yè)性排放標準不交叉執(zhí)行的原則，有專項排放標準的執(zhí)行相應的專項排放標準。例如：除有專項鍋爐標準的鍋爐執(zhí)行《鍋爐大氣污染物排放標準》（GB13271—2001），火電廠執(zhí)行《火電廠大氣污染物排放標準》（GB13233—2003），工業(yè)爐窯執(zhí)行《工業(yè)爐窯大氣污染物排放標準》（GB9078—1996），煉焦爐執(zhí)行《煉焦爐大氣污染物排放標準》（GB16171—1996），水泥廠執(zhí)行《水泥廠大氣污染物排放標準》（GB4915—1996），惡臭物質排放執(zhí)行《惡臭污染物排放標準》（GB14554—93），各類機動車排放執(zhí)行相應的標準，其他大氣污染物排放均執(zhí)行《大氣污染物綜合排放標準》（GB16297—1996）。
再頒布的行業(yè)性國家大氣污染物排放標準，按其適用范圍規(guī)定的污染源不再執(zhí)行《大氣污染物綜合排放標準》（GB16297—1996）。本標準適用于現有污染源大氣污染物排放管理以及建設項目的環(huán)境影響評價、設計、環(huán)境保護設施竣工驗收及其投產后的大氣污染物排放管理。
再頒布的行業(yè)性國家大氣污染物排放標準，按其適用范圍規(guī)定的污染源不再執(zhí)行《大氣污染物綜合排放標準》（GB16297—1996）。本標準適用于現有污染源大氣污染物排放管理以及建設項目的環(huán)境影響評價、設計、環(huán)境保護設施竣工驗收及其投產后的大氣污染物排放管理。