生態(tài)影響防護通常以替代方案的形式來實現(xiàn)。開發(fā)建設項目的替代方案主要有場址或線路走向的替代、施工方式的替代、工藝技術替代、生態(tài)保護措施替代等。這些替代措施可以對生態(tài)影響起到避免、消減和補償?shù)淖饔?。并達到生態(tài)環(huán)境損失最小、費用最少、生態(tài)功能的效果。
1．生態(tài)影響的避免
生態(tài)影響的避免就是采取適當?shù)拇胧?、盡可能在程度上避免潛在的不利生態(tài)影響。因為有些類型的生態(tài)環(huán)境一經破壞就不能再恢復，而這類生態(tài)系統(tǒng)具有重要保護價值或特別重要的生態(tài)功能作用，因此必須予以絕對的保護。采取的措施通常包括更改工程場址、修改工程設計、限制施工方法或時問、道路改線、變更規(guī)劃或工程規(guī)模等。在極端情況下，當生態(tài)影響評價發(fā)現(xiàn)一些非常嚴重又不能避免的影響時，否決整個工程項目可能是切合實際的避免方案。如工程建設涉及到一些重要濕地、珊瑚礁、紅樹林、原始森林、水源地、地質遺址、重要棲息地等，一般要考慮采取避免措施。
2．生態(tài)影響的防護、恢復
采取適當?shù)拇胧?，盡量減少不可避免的生態(tài)影響的程度和范圍。如遷移重要的物種，把工程限于某一特定地方或季節(jié)進行，對受干擾的生境進行修復等。采取適當隔離措施或建立通道等均可在一定程度上減少負面生態(tài)影響。
3．生態(tài)影響的補償
當重要物種（如樹木）、生境（例如林地）及資源受到工程影響時，可采取在當?shù)鼗虍惖兀üこ虉鲋穬然驁鲋吠猓┨峁┩瑯游锓N或相似生境的方法得到補償。例如大型開發(fā)區(qū)的建設可能會侵占大片林地或草地，可以通過區(qū)內適當?shù)木G化面積和綠化類型的搭配加以補償。就地補償類似于生態(tài)恢復，但建立的新生態(tài)系統(tǒng)和原生態(tài)系統(tǒng)不可能也沒有必要完全一致。異地補償則是在項目建設地無法補償損失的生態(tài)環(huán)境功能時，在項目發(fā)生地之外實施補償措施，如在區(qū)域內或流域內的適宜地點或在其他規(guī)劃的生態(tài)建設工程中。異地補償特別要注意補償?shù)攸c和補償形式與建設地區(qū)生態(tài)類型和功能的聯(lián)系，以及補償量的等當量關系。
生態(tài)影響的防護對于建設項目的設計、施工、運行和管理是非常重要的。生態(tài)影響評價工作不但要發(fā)現(xiàn)建設項目可能產生的生態(tài)影響，更重要的是能夠提出避免、消減或補償?shù)拇胧┙ㄗh。防護重要生境及野生生物可能受工程影響的措施，按優(yōu)先次序選擇，應遵循“避免→消減→補償”這一順序。也就是說，能避免的盡量避免，實在不能避免的則采取措施消減，消減不能奏效的就應有必要的補償方案。
1．生態(tài)影響的避免
生態(tài)影響的避免就是采取適當?shù)拇胧?、盡可能在程度上避免潛在的不利生態(tài)影響。因為有些類型的生態(tài)環(huán)境一經破壞就不能再恢復，而這類生態(tài)系統(tǒng)具有重要保護價值或特別重要的生態(tài)功能作用，因此必須予以絕對的保護。采取的措施通常包括更改工程場址、修改工程設計、限制施工方法或時問、道路改線、變更規(guī)劃或工程規(guī)模等。在極端情況下，當生態(tài)影響評價發(fā)現(xiàn)一些非常嚴重又不能避免的影響時，否決整個工程項目可能是切合實際的避免方案。如工程建設涉及到一些重要濕地、珊瑚礁、紅樹林、原始森林、水源地、地質遺址、重要棲息地等，一般要考慮采取避免措施。
2．生態(tài)影響的防護、恢復
采取適當?shù)拇胧?，盡量減少不可避免的生態(tài)影響的程度和范圍。如遷移重要的物種，把工程限于某一特定地方或季節(jié)進行，對受干擾的生境進行修復等。采取適當隔離措施或建立通道等均可在一定程度上減少負面生態(tài)影響。
3．生態(tài)影響的補償
當重要物種（如樹木）、生境（例如林地）及資源受到工程影響時，可采取在當?shù)鼗虍惖兀üこ虉鲋穬然驁鲋吠猓┨峁┩瑯游锓N或相似生境的方法得到補償。例如大型開發(fā)區(qū)的建設可能會侵占大片林地或草地，可以通過區(qū)內適當?shù)木G化面積和綠化類型的搭配加以補償。就地補償類似于生態(tài)恢復，但建立的新生態(tài)系統(tǒng)和原生態(tài)系統(tǒng)不可能也沒有必要完全一致。異地補償則是在項目建設地無法補償損失的生態(tài)環(huán)境功能時，在項目發(fā)生地之外實施補償措施，如在區(qū)域內或流域內的適宜地點或在其他規(guī)劃的生態(tài)建設工程中。異地補償特別要注意補償?shù)攸c和補償形式與建設地區(qū)生態(tài)類型和功能的聯(lián)系，以及補償量的等當量關系。
生態(tài)影響的防護對于建設項目的設計、施工、運行和管理是非常重要的。生態(tài)影響評價工作不但要發(fā)現(xiàn)建設項目可能產生的生態(tài)影響，更重要的是能夠提出避免、消減或補償?shù)拇胧┙ㄗh。防護重要生境及野生生物可能受工程影響的措施，按優(yōu)先次序選擇，應遵循“避免→消減→補償”這一順序。也就是說，能避免的盡量避免，實在不能避免的則采取措施消減，消減不能奏效的就應有必要的補償方案。