修訂后的《審計法》第四十一條規(guī)定：“審計機關(guān)按照審計署規(guī)定的程序?qū)徲嫿M的審計報告進行審議，并對被審計對象對審計組的審計報告提出的意見一并研究后，提出審計機關(guān)的審計報告”，從而取消了“審計意見書”，將“審計機關(guān)的審計報告”確立為審計機關(guān)對外發(fā)表審計意見的審計法律文書。
本條修改的理由是：第一，為了與國際通行做法接軌，有必要將“審計意見書”改為“審計機關(guān)的審計報告”，作為對外發(fā)表審計意見、公告審計結(jié)果的載體，建立起我國的審計報告制度和審計結(jié)果公告制度。第二，規(guī)定審計機關(guān)要研究“被審計對象對審計組的審計報告提出的意見”，是為了進一步督促審計機關(guān)要重視被審計對象的意見，從而保證審計報告的質(zhì)量。
理解本條規(guī)定，應(yīng)當(dāng)注意把握以下三點：
第一，自2006年6月1日起，各級審計機關(guān)均不再出具審計意見書，代之以審計機關(guān)的審計報告。
第二，審計機關(guān)應(yīng)當(dāng)按照審計署規(guī)定的程序?qū)徲嫿M的審計報告進行審議，出具審計機關(guān)的審計報告。根據(jù)本條，結(jié)合審計署6號令和其他有關(guān)規(guī)定，審計機關(guān)應(yīng)當(dāng)按照以下程序?qū)徲嫿M的審計報告進行審議：
一是審計組所在部門應(yīng)當(dāng)對審計組的審計報告及相關(guān)材料進行全面復(fù)核，對被審計對象對審計組的審計報告提出的書面意見進行認真研究，提出書面復(fù)核意見。
二是審計組所在部門應(yīng)當(dāng)在復(fù)核審計組的審計報告的基礎(chǔ)上，代擬審計機關(guān)的審計報告。對被審計單位違反國家規(guī)定的財政財務(wù)收支行為依法應(yīng)當(dāng)給予處理、處罰的，還應(yīng)當(dāng)代擬審計決定書；
對審計發(fā)現(xiàn)的依法應(yīng)當(dāng)由其他有關(guān)部門糾正、處理、處罰或者追究有關(guān)責(zé)任人員行政責(zé)任、刑事責(zé)任的，還應(yīng)當(dāng)代擬審計移送處理書。此外，需要對被審計單位和有關(guān)責(zé)任人員作出較大數(shù)額罰款的處罰決定的，還應(yīng)當(dāng)代擬審計聽證告知書，履行《行政處罰法》第四十二條規(guī)定的聽證告知程序。
三是法制工作機構(gòu)應(yīng)對審計組所在部門代擬的審計機關(guān)的審計報告、審計決定書、審計移送處理書等進行復(fù)核，對被審計對象對審計組的審計報告提出的書面意見進行認真研究，出具復(fù)核意見書。
四是法制工作機構(gòu)復(fù)核后，審計組所在部門應(yīng)當(dāng)將代擬的審計機關(guān)的審計報告、審計決定書、審計移送處理書、法制工作機構(gòu)的復(fù)核意見書以及被審計對象對審計組的審計報告提出的書面意見，報送審計機關(guān)分管領(lǐng)導(dǎo)，由審計機關(guān)召開小型審計業(yè)務(wù)會議或者審計業(yè)務(wù)會議審定。
會后，審計機關(guān)應(yīng)指定專門部門根據(jù)審計業(yè)務(wù)會議決定，修改審計機關(guān)的審計報告、審計決定書和審計移送處理書。
五是審計機關(guān)的審計報告、審計決定書、審計移送處理書經(jīng)審計機關(guān)審定后，由審計機關(guān)分管領(lǐng)導(dǎo)或者主要負責(zé)人簽發(fā)，正式對外出具。
第三，審計機關(guān)應(yīng)當(dāng)及時將審計機關(guān)
的審計報告、審計決定書送達被審計單位和有關(guān)主管機關(guān)、單位，將審計移送處理書送達有關(guān)單位。審計機關(guān)送達審計文書，可以直接送達，也可以郵寄送達或者以機要交換方式送達。直接送達的，以被審計對象在送達回證上注明的簽收日期或者見證人證明的收件日期為送達日期；郵寄送達的，以郵政回執(zhí)上注明的收件日期為送達日期；以機要交換方式送達的，以機要件的簽收或收件日期為送達日期。
本條修改的理由是：第一，為了與國際通行做法接軌，有必要將“審計意見書”改為“審計機關(guān)的審計報告”，作為對外發(fā)表審計意見、公告審計結(jié)果的載體，建立起我國的審計報告制度和審計結(jié)果公告制度。第二，規(guī)定審計機關(guān)要研究“被審計對象對審計組的審計報告提出的意見”，是為了進一步督促審計機關(guān)要重視被審計對象的意見，從而保證審計報告的質(zhì)量。
理解本條規(guī)定，應(yīng)當(dāng)注意把握以下三點：
第一，自2006年6月1日起，各級審計機關(guān)均不再出具審計意見書，代之以審計機關(guān)的審計報告。
第二，審計機關(guān)應(yīng)當(dāng)按照審計署規(guī)定的程序?qū)徲嫿M的審計報告進行審議，出具審計機關(guān)的審計報告。根據(jù)本條，結(jié)合審計署6號令和其他有關(guān)規(guī)定，審計機關(guān)應(yīng)當(dāng)按照以下程序?qū)徲嫿M的審計報告進行審議：
一是審計組所在部門應(yīng)當(dāng)對審計組的審計報告及相關(guān)材料進行全面復(fù)核，對被審計對象對審計組的審計報告提出的書面意見進行認真研究，提出書面復(fù)核意見。
二是審計組所在部門應(yīng)當(dāng)在復(fù)核審計組的審計報告的基礎(chǔ)上，代擬審計機關(guān)的審計報告。對被審計單位違反國家規(guī)定的財政財務(wù)收支行為依法應(yīng)當(dāng)給予處理、處罰的，還應(yīng)當(dāng)代擬審計決定書；
對審計發(fā)現(xiàn)的依法應(yīng)當(dāng)由其他有關(guān)部門糾正、處理、處罰或者追究有關(guān)責(zé)任人員行政責(zé)任、刑事責(zé)任的，還應(yīng)當(dāng)代擬審計移送處理書。此外，需要對被審計單位和有關(guān)責(zé)任人員作出較大數(shù)額罰款的處罰決定的，還應(yīng)當(dāng)代擬審計聽證告知書，履行《行政處罰法》第四十二條規(guī)定的聽證告知程序。
三是法制工作機構(gòu)應(yīng)對審計組所在部門代擬的審計機關(guān)的審計報告、審計決定書、審計移送處理書等進行復(fù)核，對被審計對象對審計組的審計報告提出的書面意見進行認真研究，出具復(fù)核意見書。
四是法制工作機構(gòu)復(fù)核后，審計組所在部門應(yīng)當(dāng)將代擬的審計機關(guān)的審計報告、審計決定書、審計移送處理書、法制工作機構(gòu)的復(fù)核意見書以及被審計對象對審計組的審計報告提出的書面意見，報送審計機關(guān)分管領(lǐng)導(dǎo)，由審計機關(guān)召開小型審計業(yè)務(wù)會議或者審計業(yè)務(wù)會議審定。
會后，審計機關(guān)應(yīng)指定專門部門根據(jù)審計業(yè)務(wù)會議決定，修改審計機關(guān)的審計報告、審計決定書和審計移送處理書。
五是審計機關(guān)的審計報告、審計決定書、審計移送處理書經(jīng)審計機關(guān)審定后，由審計機關(guān)分管領(lǐng)導(dǎo)或者主要負責(zé)人簽發(fā)，正式對外出具。
第三，審計機關(guān)應(yīng)當(dāng)及時將審計機關(guān)
的審計報告、審計決定書送達被審計單位和有關(guān)主管機關(guān)、單位，將審計移送處理書送達有關(guān)單位。審計機關(guān)送達審計文書，可以直接送達，也可以郵寄送達或者以機要交換方式送達。直接送達的，以被審計對象在送達回證上注明的簽收日期或者見證人證明的收件日期為送達日期；郵寄送達的，以郵政回執(zhí)上注明的收件日期為送達日期；以機要交換方式送達的，以機要件的簽收或收件日期為送達日期。