國務(wù)院55號令、《城市房地產(chǎn)管理法》以及國土資源部新修訂的土地出讓合同文本的規(guī)定都是一致的，即重新簽訂土地出讓合同，支付土地出讓金。20世紀(jì)90年代初各地進(jìn)行土地出讓時，土地使用者除支付土地出讓金外，還支付土地補(bǔ)償、拆遷費及其他有關(guān)稅費。當(dāng)時，土地出讓金一般只占到使用者支付土地總費用的25％左右。如今大多地方都實行統(tǒng)一征地收購、儲備、開發(fā)，而后統(tǒng)一出讓的土地集中供應(yīng)模式，土地使用者將所有費用即全部地價款以土地出讓金的形式支付給國家。
2003年6月的國土資源部21號令規(guī)定，協(xié)議出讓國有土地使用權(quán)時土地出讓金不得低于按國家規(guī)定的，協(xié)議出讓不得低于新增建設(shè)用地有償使用費、征地拆遷補(bǔ)償費用以及按國家規(guī)定應(yīng)當(dāng)繳納的有關(guān)稅費之和，有基準(zhǔn)地價的不低于基準(zhǔn)地價的70％。
2003年6月的國土資源部21號令規(guī)定，協(xié)議出讓國有土地使用權(quán)時土地出讓金不得低于按國家規(guī)定的，協(xié)議出讓不得低于新增建設(shè)用地有償使用費、征地拆遷補(bǔ)償費用以及按國家規(guī)定應(yīng)當(dāng)繳納的有關(guān)稅費之和，有基準(zhǔn)地價的不低于基準(zhǔn)地價的70％。