四、合同變更
企業(yè)辦理合同變更海關手續(xù)應提交的單證及流程如下：
（一）應提交單證：
1.變更合同一式兩份；2.外經(jīng)貿(mào)部門簽發(fā)的《加工貿(mào)易業(yè)務批準證》一式兩份；3.海關核發(fā)的《登記手冊》；4.《變更預錄入呈報表》；5.按規(guī)定需提交的其他單證。
（二）作業(yè)流程
企業(yè)報原加工貿(mào)易審批機關批準——企業(yè)向海關申請——海關審核—海關簽發(fā)《銀行保證金臺帳變更聯(lián)系單》—企業(yè)到指定銀行辦理臺帳變更手續(xù)——登記《銀行保證金臺帳變更通知單》—核發(fā)已變更《登記手冊》。
五、加工貿(mào)易分冊
企業(yè)申辦加工貿(mào)易分冊及分冊變更手續(xù)應提交的單證及流程如下：
（一）應提交單證
1.《加工貿(mào)易分冊申請表》；2.海關核發(fā)的加工貿(mào)易《登記手冊》（總冊）；3.《登記手冊》（分冊）；4.按規(guī)定需提交的其他單證。
（二）分冊變更
1.分冊進口及出口商品的序號、品名、規(guī)格型號、計量單位不得變更；2.總冊發(fā)生變更，涉及下列情況的，分冊內(nèi)容應做相應變更：（1）刪除總冊某一異地口岸；（2）刪除總冊進口或出口商品項；（3）減少總冊某一進口料件或出口成品數(shù)量。
（三）作業(yè)流程
企業(yè)向海關申請——海關審核—核發(fā)分冊。
六、發(fā)外加工
企業(yè)辦理發(fā)外加工手續(xù)應提交的單證及有關規(guī)定如下：
（一）企業(yè)申請外發(fā)加工，應同時符合下列四個條件：
1.對在生產(chǎn)加工過程中的某個加工工序，企業(yè)無生產(chǎn)條件，確需委托其他企業(yè)加工，且產(chǎn)權(quán)不轉(zhuǎn)移的；
2.委托企業(yè)須事先向主管海關提出外發(fā)加工的書面申請，說明申請理由、受委托的加工企業(yè)情況、損耗情況及加工后返還日期等；
3.委托企業(yè)與加工企業(yè)須簽訂符合《中華人民共和國合同法》規(guī)定的“委托加工合同”；
4.外發(fā)加工料件必須從委托企業(yè)發(fā)出，加工完畢后，產(chǎn)品、余料、邊角料等必須全部返回委托企業(yè)。
（二）應提交單證
1.《中華人民共和國海關保稅貨物委托加工申請表》（以下簡稱《委托加工申請表》）一式三份；2.委托加工合同二份；3.委托企業(yè)及承接加工企業(yè)《營業(yè)執(zhí)照》、法定代表人身份證明復印件；4.《登記手冊》；5.按規(guī)定需提交的其他單證。
（三）外發(fā)加工成品必須在海關規(guī)定的期限內(nèi)運回委托企業(yè)。合同核銷時，委托企業(yè)須向海關提交《委托加工申請表》和有關送貨單。
加工貿(mào)易是中國重要出口貿(mào)易形式，中國加工貿(mào)易形成了穩(wěn)定的外貿(mào)操作方式，對加工貿(mào)易單證及流程進行總結(jié)，有利于加工企業(yè)的單證操作。
七、深加工結(jié)轉(zhuǎn)
（一）向轉(zhuǎn)出地海關備案開展深加工結(jié)轉(zhuǎn)，應提交單證：
1出口方的《登記手冊》（復印件），復印內(nèi)容應包括手冊封面、加工合同備案情況表；
2《申請表》（一式四聯(lián)）；
（二）向轉(zhuǎn)入地海關申請開展深加工結(jié)轉(zhuǎn)，應提交單證：
1《申請表》（第二、三、四聯(lián)）；
2結(jié)轉(zhuǎn)雙方企業(yè)的《登記手冊》（復印件），復印內(nèi)容應包括手冊封面、加工合同備案情況表；
（三）作業(yè)流程企業(yè)向轉(zhuǎn)出地海關備案—企業(yè)向轉(zhuǎn)入地海關申報—經(jīng)轉(zhuǎn)入地海關批準后，轉(zhuǎn)入、轉(zhuǎn)出企業(yè)在結(jié)轉(zhuǎn)計劃有效期內(nèi)送貨完畢—轉(zhuǎn)入、轉(zhuǎn)出企業(yè)各自向其主管海關如實辦理報關手續(xù)。
八、合同余料結(jié)轉(zhuǎn)
應提交單證：
（一）轉(zhuǎn)入、轉(zhuǎn)出企業(yè)的《登記手冊》；（二）進口和出口貨物報關單（手寫單）；（三）申請企業(yè)的書面報告；（四）余料結(jié)轉(zhuǎn)申請表。
九、保稅貨物內(nèi)銷
（一）應提交單證
1.《登記手冊》；
2.進口貨物報關單（手寫單）；
3.申請企業(yè)的書面報告；
4.外經(jīng)貿(mào)主管部門的批件；
5.按規(guī)定需交驗的各種許可證件；
（二）作業(yè)流程
企業(yè)向海關加工貿(mào)易監(jiān)管部門申請——海關審核并制作關封交企業(yè)—企業(yè)到現(xiàn)場辦理征稅手續(xù)。
十、加工貿(mào)易料件退運或退換的處理
（一）受理范圍
1.加工貿(mào)易進口料件在進境結(jié)關后因發(fā)錯貨、料件質(zhì)量及規(guī)格型號不符，需退運或退換的；
2.合同中止或變更，有關原材料需退運出境的；
3.合同執(zhí)行完畢，辦理核銷手續(xù)時，剩余料件需退運出境的；
4.退運的類別：來料料件復出0265、來料料件退換0300、來料邊角料復出0865、進料料件復出0664、進料料件退換0700、進料邊角料復出0864.對直接退運貨物，按直接退運貨物的管理辦法辦理。
（二）應提交單證
1.書面申請報告（說明退換或退運的原因、復進口的時間，由合同雙方簽章）；
2.《登記手冊》；
3.原進口貨物報關單復印件以及手寫出口報關單（原材料退運才提供）；
4.《加工貿(mào)易料件退運申請表》一式兩份；
5.按規(guī)定需提交的其他單證（如外商要求退運的有關文件，質(zhì)量檢驗證明等）。
企業(yè)辦理合同變更海關手續(xù)應提交的單證及流程如下：
（一）應提交單證：
1.變更合同一式兩份；2.外經(jīng)貿(mào)部門簽發(fā)的《加工貿(mào)易業(yè)務批準證》一式兩份；3.海關核發(fā)的《登記手冊》；4.《變更預錄入呈報表》；5.按規(guī)定需提交的其他單證。
（二）作業(yè)流程
企業(yè)報原加工貿(mào)易審批機關批準——企業(yè)向海關申請——海關審核—海關簽發(fā)《銀行保證金臺帳變更聯(lián)系單》—企業(yè)到指定銀行辦理臺帳變更手續(xù)——登記《銀行保證金臺帳變更通知單》—核發(fā)已變更《登記手冊》。
五、加工貿(mào)易分冊
企業(yè)申辦加工貿(mào)易分冊及分冊變更手續(xù)應提交的單證及流程如下：
（一）應提交單證
1.《加工貿(mào)易分冊申請表》；2.海關核發(fā)的加工貿(mào)易《登記手冊》（總冊）；3.《登記手冊》（分冊）；4.按規(guī)定需提交的其他單證。
（二）分冊變更
1.分冊進口及出口商品的序號、品名、規(guī)格型號、計量單位不得變更；2.總冊發(fā)生變更，涉及下列情況的，分冊內(nèi)容應做相應變更：（1）刪除總冊某一異地口岸；（2）刪除總冊進口或出口商品項；（3）減少總冊某一進口料件或出口成品數(shù)量。
（三）作業(yè)流程
企業(yè)向海關申請——海關審核—核發(fā)分冊。
六、發(fā)外加工
企業(yè)辦理發(fā)外加工手續(xù)應提交的單證及有關規(guī)定如下：
（一）企業(yè)申請外發(fā)加工，應同時符合下列四個條件：
1.對在生產(chǎn)加工過程中的某個加工工序，企業(yè)無生產(chǎn)條件，確需委托其他企業(yè)加工，且產(chǎn)權(quán)不轉(zhuǎn)移的；
2.委托企業(yè)須事先向主管海關提出外發(fā)加工的書面申請，說明申請理由、受委托的加工企業(yè)情況、損耗情況及加工后返還日期等；
3.委托企業(yè)與加工企業(yè)須簽訂符合《中華人民共和國合同法》規(guī)定的“委托加工合同”；
4.外發(fā)加工料件必須從委托企業(yè)發(fā)出，加工完畢后，產(chǎn)品、余料、邊角料等必須全部返回委托企業(yè)。
（二）應提交單證
1.《中華人民共和國海關保稅貨物委托加工申請表》（以下簡稱《委托加工申請表》）一式三份；2.委托加工合同二份；3.委托企業(yè)及承接加工企業(yè)《營業(yè)執(zhí)照》、法定代表人身份證明復印件；4.《登記手冊》；5.按規(guī)定需提交的其他單證。
（三）外發(fā)加工成品必須在海關規(guī)定的期限內(nèi)運回委托企業(yè)。合同核銷時，委托企業(yè)須向海關提交《委托加工申請表》和有關送貨單。
加工貿(mào)易是中國重要出口貿(mào)易形式，中國加工貿(mào)易形成了穩(wěn)定的外貿(mào)操作方式，對加工貿(mào)易單證及流程進行總結(jié)，有利于加工企業(yè)的單證操作。
七、深加工結(jié)轉(zhuǎn)
（一）向轉(zhuǎn)出地海關備案開展深加工結(jié)轉(zhuǎn)，應提交單證：
1出口方的《登記手冊》（復印件），復印內(nèi)容應包括手冊封面、加工合同備案情況表；
2《申請表》（一式四聯(lián)）；
（二）向轉(zhuǎn)入地海關申請開展深加工結(jié)轉(zhuǎn)，應提交單證：
1《申請表》（第二、三、四聯(lián)）；
2結(jié)轉(zhuǎn)雙方企業(yè)的《登記手冊》（復印件），復印內(nèi)容應包括手冊封面、加工合同備案情況表；
（三）作業(yè)流程企業(yè)向轉(zhuǎn)出地海關備案—企業(yè)向轉(zhuǎn)入地海關申報—經(jīng)轉(zhuǎn)入地海關批準后，轉(zhuǎn)入、轉(zhuǎn)出企業(yè)在結(jié)轉(zhuǎn)計劃有效期內(nèi)送貨完畢—轉(zhuǎn)入、轉(zhuǎn)出企業(yè)各自向其主管海關如實辦理報關手續(xù)。
八、合同余料結(jié)轉(zhuǎn)
應提交單證：
（一）轉(zhuǎn)入、轉(zhuǎn)出企業(yè)的《登記手冊》；（二）進口和出口貨物報關單（手寫單）；（三）申請企業(yè)的書面報告；（四）余料結(jié)轉(zhuǎn)申請表。
九、保稅貨物內(nèi)銷
（一）應提交單證
1.《登記手冊》；
2.進口貨物報關單（手寫單）；
3.申請企業(yè)的書面報告；
4.外經(jīng)貿(mào)主管部門的批件；
5.按規(guī)定需交驗的各種許可證件；
（二）作業(yè)流程
企業(yè)向海關加工貿(mào)易監(jiān)管部門申請——海關審核并制作關封交企業(yè)—企業(yè)到現(xiàn)場辦理征稅手續(xù)。
十、加工貿(mào)易料件退運或退換的處理
（一）受理范圍
1.加工貿(mào)易進口料件在進境結(jié)關后因發(fā)錯貨、料件質(zhì)量及規(guī)格型號不符，需退運或退換的；
2.合同中止或變更，有關原材料需退運出境的；
3.合同執(zhí)行完畢，辦理核銷手續(xù)時，剩余料件需退運出境的；
4.退運的類別：來料料件復出0265、來料料件退換0300、來料邊角料復出0865、進料料件復出0664、進料料件退換0700、進料邊角料復出0864.對直接退運貨物，按直接退運貨物的管理辦法辦理。
（二）應提交單證
1.書面申請報告（說明退換或退運的原因、復進口的時間，由合同雙方簽章）；
2.《登記手冊》；
3.原進口貨物報關單復印件以及手寫出口報關單（原材料退運才提供）；
4.《加工貿(mào)易料件退運申請表》一式兩份；
5.按規(guī)定需提交的其他單證（如外商要求退運的有關文件，質(zhì)量檢驗證明等）。