（一）免疫熒光標記最常用的熒光染料
最常用的染料有FITC和藻紅蛋白類（PE）及羅丹明等。
FITC（異硫氰酸熒光素）：綠色530nm
PE（藻紅蛋白）：橙黃色575nm
PerCP（多甲藻黃素葉綠素蛋白）：深紅色675nm
PI（碘化丙啶）：橙紅色620nm
488nm波長的氬離子激光激發(fā)
APC（別藻青蛋白）：紅色660nm
630nm波長的氦氖激光或紅色二極管激光激發(fā)
（二）免疫熒光標記
常用的標記染色為直接免疫熒光染色和間接免疫熒光染色。在進行雙參數(shù)或多參數(shù)分析時，常常需要進行熒光抗體的組合標記，目前已經有雙色、三色以及四色標記。
（三）細胞自發(fā)熒光
自發(fā)熒光信號為噪聲信號，在多數(shù)情況下會干擾對特異熒光信號的分辨和測量。在免疫細胞化學等測量中，對于結合水平不高的熒光抗體來說，如何提高信噪比是個關鍵。一般說來，細胞成分中能夠產生自發(fā)熒光的分子（例如核黃素、細胞色素等）的含量越高，自發(fā)熒光越強；培養(yǎng)細胞中死細胞／活細胞比例越高，自發(fā)熒光越強；細胞樣品中所含亮細胞的比例越高，自發(fā)熒光越強。
最常用的染料有FITC和藻紅蛋白類（PE）及羅丹明等。
FITC（異硫氰酸熒光素）：綠色530nm
PE（藻紅蛋白）：橙黃色575nm
PerCP（多甲藻黃素葉綠素蛋白）：深紅色675nm
PI（碘化丙啶）：橙紅色620nm
488nm波長的氬離子激光激發(fā)
APC（別藻青蛋白）：紅色660nm
630nm波長的氦氖激光或紅色二極管激光激發(fā)
（二）免疫熒光標記
常用的標記染色為直接免疫熒光染色和間接免疫熒光染色。在進行雙參數(shù)或多參數(shù)分析時，常常需要進行熒光抗體的組合標記，目前已經有雙色、三色以及四色標記。
（三）細胞自發(fā)熒光
自發(fā)熒光信號為噪聲信號，在多數(shù)情況下會干擾對特異熒光信號的分辨和測量。在免疫細胞化學等測量中，對于結合水平不高的熒光抗體來說，如何提高信噪比是個關鍵。一般說來，細胞成分中能夠產生自發(fā)熒光的分子（例如核黃素、細胞色素等）的含量越高，自發(fā)熒光越強；培養(yǎng)細胞中死細胞／活細胞比例越高，自發(fā)熒光越強；細胞樣品中所含亮細胞的比例越高，自發(fā)熒光越強。