過境動物必須是經(jīng)輸出國（地區(qū)）檢驗檢疫合格的，并有輸出國（地區(qū)）官方機構出具的動物檢疫證書。過境動物須辦理的檢驗檢疫手續(xù)包括：
（一）、辦理過境檢疫審批
動物入境前，貨主或其代理人須直接向國家質檢總局提出動物過境檢疫申請，按要求填寫《中華人民共和國動物過境檢疫申請表》，說明擬過境的路線，并提供以下資料：
1 輸出國官方機構出具的動物檢疫證書復印件；
2 目的地或運輸途經(jīng)下一個國家、地區(qū)官方機構出具的動物進境檢疫許可證或動物接收證復印件。
有以下情況者，過境申請不被批準：
1 輸出國家、地區(qū)或進入中國國境前所途經(jīng)國家、地區(qū)發(fā)生一類動物傳染病、新發(fā)病或其他嚴重威脅我國畜牧業(yè)和人體健康的疾病，擬過境動物屬該疫病的易感動物；
2 無輸出國、地區(qū)官方檢驗檢疫證書；
3 無目的地或運輸途經(jīng)下一個國家、地區(qū)官方機構出具的動物進境檢疫許可證或動物接收證。
（二）、入境報檢
動物進境前或進境時，承運人或押運人應向《動物過境檢疫許可證》指定的入境口岸檢驗檢疫機構報檢，并提供以下資料：
1 貨運單；
2 有效的輸出國官方動物檢疫證書正本；
3 輸出國或途經(jīng)國官方機構出具的過境動物使用飼料、鋪墊材料檢疫證書正本；
4 國家總局簽發(fā)的《動物過境檢疫許可證》。
以上證單經(jīng)審核合格，由入境口岸檢驗檢疫機構簽發(fā)《入境貨物單》將過境動物調離到離境口岸。單上注明動物過境期間的檢疫防疫要求。
無《動物過境檢疫許可證》及輸出國官方機構出具的動物檢疫證書的，入境口岸檢驗檢疫機構將不予受理報檢，動物不得過境。《動物過境檢疫許可證》超過有效期的，在規(guī)定期限內補辦過境檢疫許可手續(xù)后，可重新辦理報檢手續(xù)。
（三）、入境口岸現(xiàn)場檢驗檢疫
動物到達前貨主或其代理人要提前預報準確的到港時間，并做好和接卸準備。動物到達入境口岸后，口岸檢驗檢疫人員將對過境動物實施現(xiàn)場檢驗檢疫，未經(jīng)現(xiàn)場檢驗檢疫合格，任何人不得擅自將動物卸離運輸工具。現(xiàn)場檢驗檢疫工作主要包括以下內容：
1登機（輪）了解動物啟運時間、港口、途徑國家或地區(qū)，并與《過境許可證》的有關要求進行核對。向承運人了解飼養(yǎng)管理、病、死及飼料等情況
2查驗產(chǎn)地國（地區(qū)）官方檢疫證書、貨運單、貿(mào)易合同等，核對是否貨證相符。
3檢查裝載過境動物的運輸工具、籠具是否完好并能防止?jié)B漏。動物在吸血昆蟲活動季節(jié)過境時，其運輸工具、籠具還須裝置有效的防護設施。
4在指定的場對過境動物進行臨床檢查，觀察動物是否有傳染病癥狀、死亡、流產(chǎn)、異常排泄物等，有傳染病癥狀的，采樣送檢驗室檢驗。
5對裝載過境動物的運輸工具、籠具、接近動物的人員，以及被污染的場地作防疫消毒處理；對過境動物的尸體、排泄物、鋪墊材料及其他廢棄物按防疫要求進行處理。經(jīng)現(xiàn)場檢驗檢疫合格的，同意卸離運輸工具，運往指定的出境口岸。
如在現(xiàn)場檢驗檢疫中發(fā)現(xiàn)以下情況的，按相應規(guī)定處理：
1 貨證不符或不能提供有效產(chǎn)地國（地區(qū)）官方檢疫證書的，不準過境；
2 臨床檢查發(fā)現(xiàn)動物急性死亡或有一、二類動物傳染病、寄生蟲病癥狀的，全群動物不準過境；
3 經(jīng)檢查發(fā)現(xiàn)運輸工具、籠具有可能造成途中散漏的，承運人或押運人應按檢驗檢疫機關的要求采取密封措施，無法采取密封措施的，不準過境；
4 過境動物的飼料、鋪墊材料受病蟲害污染的，作除害處理，無法處理的，不準過境和作銷毀處理；
5 動物到達前或到達時，產(chǎn)地國或地區(qū)突發(fā)動物疫情，按國家質檢總局相關公告、禁令執(zhí)行。
（四）、過境期間的檢疫監(jiān)督
檢驗檢疫機構對過境動物實施全程監(jiān)督，主要的監(jiān)管要求包括：
1 過境期間，未經(jīng)檢驗檢疫機關同意，任何人不得將過境動物卸離運輸工具；
2 過境動物須按指定路線在中國境內運輸，口岸檢驗檢疫機構對其在中國境內的運輸全過程實施檢疫監(jiān)督管理，可根據(jù)《動物過境檢疫許可證》的要求，派員監(jiān)運過境動物至出境口岸，貨主或其代理人須負責押運人員的一切費用；
3 過境期間動物尸體、排泄物、鋪墊材料及其他廢棄物必須按照檢驗檢疫機關的有關規(guī)定，進行無害化處理，不得擅自拋棄。
4 上下過境動物運輸工具的人員須經(jīng)檢驗檢疫機關允許，并接受必要的防疫消毒處理；
5 需在中國境內添裝飼料、鋪墊材料的，應事先征得檢驗檢疫機關的同意，所添裝的飼料、鋪墊材料應來自非疫區(qū)并符合獸醫(yī)衛(wèi)生要求。
動物過境途中發(fā)生一類動物傳染病、寄生蟲病，全群撲殺，發(fā)生二類動物傳染病、寄生蟲病，撲殺陽性動物。
（五）、離境檢疫
過境動物離境時，承運人憑入境口岸檢驗檢疫機構簽發(fā)的《入境貨物單》向出境口岸檢驗檢疫機構申報，出境口岸檢驗檢疫機構驗證放行，不再實施檢疫。
（一）、辦理過境檢疫審批
動物入境前，貨主或其代理人須直接向國家質檢總局提出動物過境檢疫申請，按要求填寫《中華人民共和國動物過境檢疫申請表》，說明擬過境的路線，并提供以下資料：
1 輸出國官方機構出具的動物檢疫證書復印件；
2 目的地或運輸途經(jīng)下一個國家、地區(qū)官方機構出具的動物進境檢疫許可證或動物接收證復印件。
有以下情況者，過境申請不被批準：
1 輸出國家、地區(qū)或進入中國國境前所途經(jīng)國家、地區(qū)發(fā)生一類動物傳染病、新發(fā)病或其他嚴重威脅我國畜牧業(yè)和人體健康的疾病，擬過境動物屬該疫病的易感動物；
2 無輸出國、地區(qū)官方檢驗檢疫證書；
3 無目的地或運輸途經(jīng)下一個國家、地區(qū)官方機構出具的動物進境檢疫許可證或動物接收證。
（二）、入境報檢
動物進境前或進境時，承運人或押運人應向《動物過境檢疫許可證》指定的入境口岸檢驗檢疫機構報檢，并提供以下資料：
1 貨運單；
2 有效的輸出國官方動物檢疫證書正本；
3 輸出國或途經(jīng)國官方機構出具的過境動物使用飼料、鋪墊材料檢疫證書正本；
4 國家總局簽發(fā)的《動物過境檢疫許可證》。
以上證單經(jīng)審核合格，由入境口岸檢驗檢疫機構簽發(fā)《入境貨物單》將過境動物調離到離境口岸。單上注明動物過境期間的檢疫防疫要求。
無《動物過境檢疫許可證》及輸出國官方機構出具的動物檢疫證書的，入境口岸檢驗檢疫機構將不予受理報檢，動物不得過境。《動物過境檢疫許可證》超過有效期的，在規(guī)定期限內補辦過境檢疫許可手續(xù)后，可重新辦理報檢手續(xù)。
（三）、入境口岸現(xiàn)場檢驗檢疫
動物到達前貨主或其代理人要提前預報準確的到港時間，并做好和接卸準備。動物到達入境口岸后，口岸檢驗檢疫人員將對過境動物實施現(xiàn)場檢驗檢疫，未經(jīng)現(xiàn)場檢驗檢疫合格，任何人不得擅自將動物卸離運輸工具。現(xiàn)場檢驗檢疫工作主要包括以下內容：
1登機（輪）了解動物啟運時間、港口、途徑國家或地區(qū)，并與《過境許可證》的有關要求進行核對。向承運人了解飼養(yǎng)管理、病、死及飼料等情況
2查驗產(chǎn)地國（地區(qū)）官方檢疫證書、貨運單、貿(mào)易合同等，核對是否貨證相符。
3檢查裝載過境動物的運輸工具、籠具是否完好并能防止?jié)B漏。動物在吸血昆蟲活動季節(jié)過境時，其運輸工具、籠具還須裝置有效的防護設施。
4在指定的場對過境動物進行臨床檢查，觀察動物是否有傳染病癥狀、死亡、流產(chǎn)、異常排泄物等，有傳染病癥狀的，采樣送檢驗室檢驗。
5對裝載過境動物的運輸工具、籠具、接近動物的人員，以及被污染的場地作防疫消毒處理；對過境動物的尸體、排泄物、鋪墊材料及其他廢棄物按防疫要求進行處理。經(jīng)現(xiàn)場檢驗檢疫合格的，同意卸離運輸工具，運往指定的出境口岸。
如在現(xiàn)場檢驗檢疫中發(fā)現(xiàn)以下情況的，按相應規(guī)定處理：
1 貨證不符或不能提供有效產(chǎn)地國（地區(qū)）官方檢疫證書的，不準過境；
2 臨床檢查發(fā)現(xiàn)動物急性死亡或有一、二類動物傳染病、寄生蟲病癥狀的，全群動物不準過境；
3 經(jīng)檢查發(fā)現(xiàn)運輸工具、籠具有可能造成途中散漏的，承運人或押運人應按檢驗檢疫機關的要求采取密封措施，無法采取密封措施的，不準過境；
4 過境動物的飼料、鋪墊材料受病蟲害污染的，作除害處理，無法處理的，不準過境和作銷毀處理；
5 動物到達前或到達時，產(chǎn)地國或地區(qū)突發(fā)動物疫情，按國家質檢總局相關公告、禁令執(zhí)行。
（四）、過境期間的檢疫監(jiān)督
檢驗檢疫機構對過境動物實施全程監(jiān)督，主要的監(jiān)管要求包括：
1 過境期間，未經(jīng)檢驗檢疫機關同意，任何人不得將過境動物卸離運輸工具；
2 過境動物須按指定路線在中國境內運輸，口岸檢驗檢疫機構對其在中國境內的運輸全過程實施檢疫監(jiān)督管理，可根據(jù)《動物過境檢疫許可證》的要求，派員監(jiān)運過境動物至出境口岸，貨主或其代理人須負責押運人員的一切費用；
3 過境期間動物尸體、排泄物、鋪墊材料及其他廢棄物必須按照檢驗檢疫機關的有關規(guī)定，進行無害化處理，不得擅自拋棄。
4 上下過境動物運輸工具的人員須經(jīng)檢驗檢疫機關允許，并接受必要的防疫消毒處理；
5 需在中國境內添裝飼料、鋪墊材料的，應事先征得檢驗檢疫機關的同意，所添裝的飼料、鋪墊材料應來自非疫區(qū)并符合獸醫(yī)衛(wèi)生要求。
動物過境途中發(fā)生一類動物傳染病、寄生蟲病，全群撲殺，發(fā)生二類動物傳染病、寄生蟲病，撲殺陽性動物。
（五）、離境檢疫
過境動物離境時，承運人憑入境口岸檢驗檢疫機構簽發(fā)的《入境貨物單》向出境口岸檢驗檢疫機構申報，出境口岸檢驗檢疫機構驗證放行，不再實施檢疫。