脂酰CoA進(jìn)入線粒體基質(zhì)后，在脂肪酸β氧化酶系催化下，進(jìn)行脫氫、加水，再脫氫及硫解4步連續(xù)反應(yīng)，最后使脂?；鶖嗔焉梢环肿右阴oA和一分子比原來(lái)少了兩個(gè)碳原子的脂酰CoA. 因反應(yīng)均在脂酰CoA烴鏈的α，β碳原子間進(jìn)行，最后β碳被氧化成?；?，故稱為β氧化。
a 脫氫：脂酰CoA在脂酰基CoA脫氫酶的催化下，其烴鏈的α、β位碳上各脫去一個(gè)氫原子，生成α、β烯脂酰CoA(trans-y-enoyl CoA)，脫下的兩個(gè)氫原子由該酶的輔酶FAD接受生成FAD.2H.后者經(jīng)電子傳遞鏈傳遞給氧而生成水，同時(shí)伴有兩分子ATP的生成。
b 加水：α、β烯脂酰CoA在烯酰CoA水合酶的催化下，加水生成β-羥脂酰CoA(βhydroxy acylCoA)。
c 再脫氫：β-羥脂酰CoA在β-羥脂酰CoA脫氫酶(L-βhydroxy acyl CoAdehydrogenase)催化下，脫去β碳上的2個(gè)氫原子生成β-酮脂酰CoA，脫下的氫由該酶的輔酶NAD+接受，生成NADH+H+ .后者經(jīng)電子傳遞鏈氧化生成水及3分子ATP.
d 硫解：β-酮脂酰CoA在β-酮脂酰CoA在硫解酶(β-ketoacylCoA thiolase)催化下，加一分子CoA SH使碳鏈斷裂，產(chǎn)生乙酰CoA和一個(gè)比原來(lái)少兩個(gè)碳原子的脂酰CoA.以上4步反應(yīng)均可逆行，但全過(guò)程趨向分解，尚無(wú)明確的調(diào)控位點(diǎn)。
a 脫氫：脂酰CoA在脂酰基CoA脫氫酶的催化下，其烴鏈的α、β位碳上各脫去一個(gè)氫原子，生成α、β烯脂酰CoA(trans-y-enoyl CoA)，脫下的兩個(gè)氫原子由該酶的輔酶FAD接受生成FAD.2H.后者經(jīng)電子傳遞鏈傳遞給氧而生成水，同時(shí)伴有兩分子ATP的生成。
b 加水：α、β烯脂酰CoA在烯酰CoA水合酶的催化下，加水生成β-羥脂酰CoA(βhydroxy acylCoA)。
c 再脫氫：β-羥脂酰CoA在β-羥脂酰CoA脫氫酶(L-βhydroxy acyl CoAdehydrogenase)催化下，脫去β碳上的2個(gè)氫原子生成β-酮脂酰CoA，脫下的氫由該酶的輔酶NAD+接受，生成NADH+H+ .后者經(jīng)電子傳遞鏈氧化生成水及3分子ATP.
d 硫解：β-酮脂酰CoA在β-酮脂酰CoA在硫解酶(β-ketoacylCoA thiolase)催化下，加一分子CoA SH使碳鏈斷裂，產(chǎn)生乙酰CoA和一個(gè)比原來(lái)少兩個(gè)碳原子的脂酰CoA.以上4步反應(yīng)均可逆行，但全過(guò)程趨向分解，尚無(wú)明確的調(diào)控位點(diǎn)。