電子手冊管理下的保稅加工貨物報關
進出境貨物報關——深加工結轉報關——其他保稅加工貨物的報關
（1）進出境貨物報關
①報關清單的生成
企業(yè)在加工貿易貨物進出口報關前，應從企業(yè)管理系統(tǒng)導出料號級數據生成歸并前的報關清單或通過電子口岸電子手冊系統(tǒng)按規(guī)定格式錄入檔次進出口的料號級清單數據，并向電子口岸數據中心報送。
②報關單的生成
數據中心按歸并關系和其他合并條件，將企業(yè)申報的清單生成報關單。企業(yè)通過中小企業(yè)模式聯(lián)網監(jiān)管系統(tǒng)的報關申報系統(tǒng)調出清單所生成的報關單信息后，將報關單上剩余各項填寫完畢，即可生成完整的報關單，向海關進行申報。
如屬異地報關的，本地企業(yè)將報關單補充完整后，將報關單上載，由異地報關企業(yè)下載報關單數據，進行修改、補充后向海關申報。
③報關單的修改、撤銷
異地報關的報關單被退單，且涉及修改表體商品信息的，應該由本地企業(yè)從清單開始修改，并重新上載報關單，異地下載后重新申報；如僅需修改表頭數據的，則可在異地直接修改報關單表頭信息后，直接向海關申報。（有關許可證件管理和稅收征管的規(guī)定與紙質手冊管理下的保稅加工貨物進出境報關一樣，參照紙質手冊部分的有關內容。
（2）深加工結轉報關
電子手冊保稅加工貨物深加工結轉報關與紙質手冊管理下的保稅加工貨物深加工結轉報關一樣，參照紙質手冊部分的有關內容。
（3）其他保稅加工貨物報關
電子手冊模式的聯(lián)網企業(yè)以內銷、戒指、退運、放權、銷毀等方式處理保稅進口料件、成品、副產品、殘次品、邊角料和受災貨物的報關手續(xù)與紙質手冊管理下的氣體保稅加工貨物報關一樣，參照紙質手冊部分的有關內容。
后續(xù)繳納稅費時，同樣要繳納緩稅利息（邊角料除外）。緩稅利息計息的起始日期為內銷料件或者制成品所對應的加工貿易合同項下的電子手冊記錄的首批料件進口之日，截止日為海關簽發(fā)稅款繳款書之日。
進出境貨物報關——深加工結轉報關——其他保稅加工貨物的報關
（1）進出境貨物報關
①報關清單的生成
企業(yè)在加工貿易貨物進出口報關前，應從企業(yè)管理系統(tǒng)導出料號級數據生成歸并前的報關清單或通過電子口岸電子手冊系統(tǒng)按規(guī)定格式錄入檔次進出口的料號級清單數據，并向電子口岸數據中心報送。
②報關單的生成
數據中心按歸并關系和其他合并條件，將企業(yè)申報的清單生成報關單。企業(yè)通過中小企業(yè)模式聯(lián)網監(jiān)管系統(tǒng)的報關申報系統(tǒng)調出清單所生成的報關單信息后，將報關單上剩余各項填寫完畢，即可生成完整的報關單，向海關進行申報。
如屬異地報關的，本地企業(yè)將報關單補充完整后，將報關單上載，由異地報關企業(yè)下載報關單數據，進行修改、補充后向海關申報。
③報關單的修改、撤銷
異地報關的報關單被退單，且涉及修改表體商品信息的，應該由本地企業(yè)從清單開始修改，并重新上載報關單，異地下載后重新申報；如僅需修改表頭數據的，則可在異地直接修改報關單表頭信息后，直接向海關申報。（有關許可證件管理和稅收征管的規(guī)定與紙質手冊管理下的保稅加工貨物進出境報關一樣，參照紙質手冊部分的有關內容。
（2）深加工結轉報關
電子手冊保稅加工貨物深加工結轉報關與紙質手冊管理下的保稅加工貨物深加工結轉報關一樣，參照紙質手冊部分的有關內容。
（3）其他保稅加工貨物報關
電子手冊模式的聯(lián)網企業(yè)以內銷、戒指、退運、放權、銷毀等方式處理保稅進口料件、成品、副產品、殘次品、邊角料和受災貨物的報關手續(xù)與紙質手冊管理下的氣體保稅加工貨物報關一樣，參照紙質手冊部分的有關內容。
后續(xù)繳納稅費時，同樣要繳納緩稅利息（邊角料除外）。緩稅利息計息的起始日期為內銷料件或者制成品所對應的加工貿易合同項下的電子手冊記錄的首批料件進口之日，截止日為海關簽發(fā)稅款繳款書之日。