事業(yè)單位的資金來源大致有三種：政府出資;民間集資;民間集資創(chuàng)辦，國家予以補貼。中華人民共和國的事業(yè)單位大多數(shù)是國家出資創(chuàng)辦，并受國家行政機關(guān)的監(jiān)督和管理。在中國行政編制中，事業(yè)單位的經(jīng)費與人員工資由國家財政預算的事業(yè)費開支。1978年以后，中國部分國家事業(yè)單位進行了管理體制改革,重視經(jīng)濟效益,實行經(jīng)費部分或全部自籌，減少對國家財政撥款的依賴。除國家的事業(yè)單位外，在中國還存在一定數(shù)量的集體所有制的事業(yè)單位。 80年代以來還出現(xiàn)了民辦和個人創(chuàng)辦的事業(yè)單位。20世紀90年代以前，蘇聯(lián)、東歐各國的事業(yè)單位也基本上由國家出資創(chuàng)辦，并受國家行政機關(guān)的監(jiān)督和管理。在西方國家，大部分事業(yè)單位是民間創(chuàng)辦或地方自治體設置的。在民辦的事業(yè)單位中，由教會、各種基金會主辦的占相當比重。不少大的企業(yè)集團、公司，在其內(nèi)部也創(chuàng)辦有為本集團、公司服務的各種科技開發(fā)性的事業(yè)單位。