(1)稅務規(guī)章的施行時間。按照現(xiàn)行法律、行政法規(guī)的有關(guān)規(guī)定，稅務規(guī)章一般應當自公布之日起30日后施行。但對涉及國家安全、外匯匯率、貨幣政策的確定以及公布后不立即施行將有礙規(guī)章施行的，可以自公布之日起施行。這一規(guī)定，也為稅務規(guī)章施行時間的確立開了口子，即在特殊情況下，稅務規(guī)章也可自公布之日起實施。
(2)稅務規(guī)章的解釋。稅務規(guī)章由國家稅務總局負責解釋。有下列情況之一的，國家稅務總局需要對稅務規(guī)章進行解釋：一是需要進一步明確稅務規(guī)章規(guī)定的具體含義的；二是稅務規(guī)章在實施過程中出現(xiàn)了新的情況，需要明確適用稅務規(guī)章依據(jù)的。稅務規(guī)章的解釋，包括修改和廢止，需參照稅務規(guī)章制定程序的有關(guān)規(guī)定執(zhí)行。稅務埋章解釋與稅務規(guī)章具有同等效力。
(3)稅務規(guī)章的適用。稅務規(guī)章的適用規(guī)則包括：一是稅務規(guī)章的效力低于法律、行政法規(guī)；二是稅務規(guī)章之間對同一事項都作出過規(guī)定，特別規(guī)定與一般規(guī)定不一致的，適用特別規(guī)定，新的規(guī)定與舊的規(guī)定不一致的，適用新的規(guī)定；三是稅務規(guī)章一般不應溯及既往，但為了更好地保護稅務行政相對人的權(quán)力和利益而作的特別規(guī)定除外。
(4)稅務規(guī)章的沖突裁決機制。稅務規(guī)章與地方性法規(guī)對同一事項的規(guī)定不一致，不能確定如何適用時，由國務院提出意見，國務院認為應當適用地方性法規(guī)的，稅務規(guī)章就不再適用；認為應當適用稅務規(guī)章的，應當提請全國人大常委會裁決。因為國務院的權(quán)限范圍是可以對稅務規(guī)章的合法性及合理性加以判斷，有改變或撤銷稅務規(guī)章的權(quán)力，而對地方性法規(guī)，由于其制定主體是地方人大，國務院無權(quán)改變或撤銷地方性法規(guī)，只能提請全國人大常委會裁決。
稅務規(guī)章與其他部門規(guī)章、地方政府規(guī)章對同一事項的規(guī)定不一致的，由國務院裁決。
(5)稅務規(guī)章的監(jiān)督。按照《立法法》及《規(guī)章制定程序條例》和《法規(guī)規(guī)章備案條例》的有關(guān)規(guī)定，對稅務規(guī)章的監(jiān)督主要包括：一是備案審查。稅務規(guī)章應當自公布之日起30日內(nèi)由國家稅務總局法制部門向國務院法制辦備案，國務院法制辦對報送備案的稅務規(guī)章有權(quán)加以審查。二是提請審查。國家機關(guān)、社會團體、企業(yè)事業(yè)組織、公民認為稅務規(guī)章與法律、行政法規(guī)相抵觸的，可以向國務院書面提出審查的建議，由國務院法制機構(gòu)研究處理。三是國務院有權(quán)改變或撤銷稅務規(guī)章。稅務規(guī)章具有下列情形的，應當予以改變或撤銷：超越權(quán)限的、違反上位法規(guī)定的、違背法定程序的、對同一事項的規(guī)定不一致經(jīng)裁決應當改變或撤銷的等。此外，人民法院在行政訴訟中對規(guī)章“參照”適用，對不適當?shù)亩悇找?guī)章雖然不能宣布無效或予以撤銷，但有權(quán)不適用不適當?shù)亩悇找?guī)章，這在一定程度上體現(xiàn)了對稅務規(guī)章的監(jiān)督。
(2)稅務規(guī)章的解釋。稅務規(guī)章由國家稅務總局負責解釋。有下列情況之一的，國家稅務總局需要對稅務規(guī)章進行解釋：一是需要進一步明確稅務規(guī)章規(guī)定的具體含義的；二是稅務規(guī)章在實施過程中出現(xiàn)了新的情況，需要明確適用稅務規(guī)章依據(jù)的。稅務規(guī)章的解釋，包括修改和廢止，需參照稅務規(guī)章制定程序的有關(guān)規(guī)定執(zhí)行。稅務埋章解釋與稅務規(guī)章具有同等效力。
(3)稅務規(guī)章的適用。稅務規(guī)章的適用規(guī)則包括：一是稅務規(guī)章的效力低于法律、行政法規(guī)；二是稅務規(guī)章之間對同一事項都作出過規(guī)定，特別規(guī)定與一般規(guī)定不一致的，適用特別規(guī)定，新的規(guī)定與舊的規(guī)定不一致的，適用新的規(guī)定；三是稅務規(guī)章一般不應溯及既往，但為了更好地保護稅務行政相對人的權(quán)力和利益而作的特別規(guī)定除外。
(4)稅務規(guī)章的沖突裁決機制。稅務規(guī)章與地方性法規(guī)對同一事項的規(guī)定不一致，不能確定如何適用時，由國務院提出意見，國務院認為應當適用地方性法規(guī)的，稅務規(guī)章就不再適用；認為應當適用稅務規(guī)章的，應當提請全國人大常委會裁決。因為國務院的權(quán)限范圍是可以對稅務規(guī)章的合法性及合理性加以判斷，有改變或撤銷稅務規(guī)章的權(quán)力，而對地方性法規(guī)，由于其制定主體是地方人大，國務院無權(quán)改變或撤銷地方性法規(guī)，只能提請全國人大常委會裁決。
稅務規(guī)章與其他部門規(guī)章、地方政府規(guī)章對同一事項的規(guī)定不一致的，由國務院裁決。
(5)稅務規(guī)章的監(jiān)督。按照《立法法》及《規(guī)章制定程序條例》和《法規(guī)規(guī)章備案條例》的有關(guān)規(guī)定，對稅務規(guī)章的監(jiān)督主要包括：一是備案審查。稅務規(guī)章應當自公布之日起30日內(nèi)由國家稅務總局法制部門向國務院法制辦備案，國務院法制辦對報送備案的稅務規(guī)章有權(quán)加以審查。二是提請審查。國家機關(guān)、社會團體、企業(yè)事業(yè)組織、公民認為稅務規(guī)章與法律、行政法規(guī)相抵觸的，可以向國務院書面提出審查的建議，由國務院法制機構(gòu)研究處理。三是國務院有權(quán)改變或撤銷稅務規(guī)章。稅務規(guī)章具有下列情形的，應當予以改變或撤銷：超越權(quán)限的、違反上位法規(guī)定的、違背法定程序的、對同一事項的規(guī)定不一致經(jīng)裁決應當改變或撤銷的等。此外，人民法院在行政訴訟中對規(guī)章“參照”適用，對不適當?shù)亩悇找?guī)章雖然不能宣布無效或予以撤銷，但有權(quán)不適用不適當?shù)亩悇找?guī)章，這在一定程度上體現(xiàn)了對稅務規(guī)章的監(jiān)督。