2001年7月20日，財政部、國家稅務(wù)總局下發(fā)了《關(guān)于醫(yī)療機構(gòu)有關(guān)稅收政策的通知》，對醫(yī)療衛(wèi)生機構(gòu)有關(guān)稅收政策作了進一步的明確規(guī)定。但是，由于相關(guān)政策不夠完善，在實際工作中稅收政策執(zhí)行不夠統(tǒng)一，加之稅法宣傳力度不大，使納稅人常常產(chǎn)生誤解。醫(yī)療行業(yè)，應(yīng)如何納稅？
一、分類不同，享受的政策不同
按照我國城鎮(zhèn)醫(yī)療衛(wèi)生體制改革的總體部署，所有醫(yī)療機構(gòu)將按照其性質(zhì)、功能和承擔(dān)的任務(wù)不同，分為非營利性醫(yī)療機構(gòu)和營利性醫(yī)療機構(gòu)兩大類。
所謂非營利性醫(yī)療機構(gòu)，是指政府興辦的承擔(dān)基本醫(yī)療服務(wù)并代表地方或者國家水平的醫(yī)療機構(gòu)。以享受政府財政定向補貼為主，不以營利為目的，收入用于醫(yī)療服務(wù)成本，其實際營運中的節(jié)余只能用在自身的發(fā)展上。
所謂營利性醫(yī)療機構(gòu)，是指那些醫(yī)療服務(wù)所得收益可以作為投資者經(jīng)濟回報的醫(yī)療機構(gòu)。其服務(wù)項目可以根據(jù)市場需求自定，并報經(jīng)衛(wèi)生行政部門核準(zhǔn)；醫(yī)療服務(wù)價格實行市場調(diào)節(jié)，自主定價。個體、私營、股份制、股份合作制和中外合資合作的醫(yī)療機構(gòu)一律為營利性醫(yī)療機構(gòu)。
上述非營利性醫(yī)療機構(gòu)和營利性醫(yī)療機構(gòu)均須由衛(wèi)生行政部門核定，并在執(zhí)業(yè)登記中注有“非營利性醫(yī)療機構(gòu)”或“營利性醫(yī)療機構(gòu)”，執(zhí)照方為有效。
（一）關(guān)于非營利性醫(yī)療機構(gòu)的稅收政策
非營利性醫(yī)療機構(gòu)按照國家規(guī)定價格取得的醫(yī)療服務(wù)收入，兔征各項稅收；不按照國家規(guī)定價格取得的醫(yī)療服務(wù)收入，不得享受此項稅收優(yōu)惠政策。優(yōu)惠政策免征的稅收包括：營業(yè)稅、增值稅、企業(yè)所得稅、房產(chǎn)稅、城鎮(zhèn)土地使用稅、車船使用稅等。
但是，非營利性醫(yī)療機構(gòu)從事非醫(yī)療服務(wù)取得的收入，如租賃收入、財產(chǎn)轉(zhuǎn)讓收入、培訓(xùn)收入、對外投資收入等應(yīng)按規(guī)定征收各項稅收；非營利性醫(yī)療機構(gòu)取得的非醫(yī)療服務(wù)收入，直接用于改善醫(yī)療衛(wèi)生服務(wù)條件的部分，經(jīng)稅務(wù)部門審核批準(zhǔn)可抵扣應(yīng)納稅所得額，就余額征收企業(yè)所得稅；非營利性醫(yī)療機構(gòu)的藥房為獨立的藥品零售企業(yè)，應(yīng)按國家規(guī)定征收各項稅收。
（二）關(guān)于營利性醫(yī)療機構(gòu)的稅收政策
營利性醫(yī)療機構(gòu)取得的收入，直接用于改善衛(wèi)生醫(yī)療條件的，自取得執(zhí)業(yè)登記之日起，三年內(nèi)給予下列優(yōu)惠：對取得的醫(yī)療服務(wù)收入免征營業(yè)稅；對其自產(chǎn)自用的制劑免征增值稅；對其機構(gòu)自用的房產(chǎn)、土地、車船免征房產(chǎn)稅、城鎮(zhèn)土地使用稅和車船使用稅。但是，對營利性醫(yī)療機構(gòu)的藥房為獨立的藥品零售企業(yè)，應(yīng)按規(guī)定征收各項稅收。
二、注冊類型、經(jīng)營地點不同，繳納的稅種不同
醫(yī)療機構(gòu)的登記注冊類型，將按國家行政管理部門規(guī)定劃分為三類：第一類為內(nèi)資醫(yī)療機構(gòu)；第二類港、澳、臺商投資醫(yī)療機構(gòu)；三類外商投資醫(yī)療機構(gòu)。目前，我國有關(guān)稅收政策規(guī)定，對注冊類型或經(jīng)營地點不同的醫(yī)療機構(gòu)經(jīng)營應(yīng)稅醫(yī)療服務(wù)項目，繳納的稅種各有不同。
三、稅種不同，計算的方法不同
不同的稅種，由于計稅依據(jù)、稅率不同，所以具體的計算方法也不同。
（一）營業(yè)稅。計稅依據(jù)為醫(yī)療機構(gòu)取得的醫(yī)療服務(wù)收入，稅率5％，應(yīng)納營業(yè)稅額＝醫(yī)療服務(wù)收入×5％。納稅期限分別為5日、10日、15日或一個月；具體期限由主管稅務(wù)機關(guān)根據(jù)應(yīng)納稅額的大小核定；不能按照固定期限納稅的，可以按次納稅。
（二）增值稅。計稅依據(jù)為自產(chǎn)自用制劑的銷售收入。醫(yī)療機構(gòu)屬于不經(jīng)常發(fā)生應(yīng)征增值稅行為的單位，不論其經(jīng)營規(guī)模大小或財務(wù)核算是否健全，均應(yīng)視同小規(guī)模納稅人納稅。適用征收率為6％，應(yīng)納稅額＝自產(chǎn)自用制劑的銷售收入×6％。納稅期限分別為1日、3日、5日、10日、15日或1個月，具體期限由主管稅務(wù)機關(guān)根據(jù)應(yīng)納稅額的大小核定；不能按照固定期限納稅的，可以按次納稅。
（三）城建稅及教育費附加。計稅依據(jù)為應(yīng)繳已繳的營業(yè)稅、增值稅，稅率：城建稅分別是7％（市區(qū)）、5％（縣城鎮(zhèn)）、1％（不在市區(qū)、縣城鎮(zhèn)的）；附加征收率3％。應(yīng)納城建稅及附加＝應(yīng)繳已繳營業(yè)稅、增值稅×（城建稅稅率＋附加征收率）。納稅期限，分別與營業(yè)稅、增值稅納稅期限一致。
（四）印花稅。計稅依據(jù)為經(jīng)濟活動和經(jīng)濟交往中書立、使用、領(lǐng)受具有法律效力的應(yīng)稅憑證的計稅金額或應(yīng)稅憑證件數(shù)。稅率有比例稅率和定額稅率，其中：比例稅率分為5個檔次，分別是0.05‰、0.3‰、0.5‰、1‰、4‰。因具體稅目繁多（11個稅目），故此處省略；定額稅率，“權(quán)利、許可證照”和“營業(yè)賬簿”2個稅目，均按件貼印花稅票，稅額為5元。應(yīng)納稅額＝應(yīng)稅憑證計稅金額（或應(yīng)稅憑證件數(shù)）×適用稅率。實行按次計征，自行貼花、匯貼、匯繳和委托代征的征收方式。
（五）房產(chǎn)稅。計稅依據(jù)是房產(chǎn)的計稅價值（稱之為“從價計征”），房產(chǎn)的計稅價值為房產(chǎn)原值減除10％-30％后的余值，年稅率為1.2％。應(yīng)納稅額＝應(yīng)稅房產(chǎn)原值×（1－扣除比例）×1.2％。實行按年計算，分期繳納的征收方式。
（六）城鎮(zhèn)土地使用稅。計稅依據(jù)是實際占用的土地面積。稅率采用年定額稅率，計量標(biāo)準(zhǔn)為每平方米，具體標(biāo)準(zhǔn)：大城市0.5元至10元；中等城市0.4元至8元；小城市0.3元至6元；縣城、建制鎮(zhèn)、工礦區(qū)0.2元至4元。應(yīng)納稅額＝實際占用應(yīng)稅土地面積（平方米）×適用稅率。實行按年計算，分期繳納的征收方式。
（七）城市房地產(chǎn)稅。計稅依據(jù)為標(biāo)準(zhǔn)房價或標(biāo)準(zhǔn)地價。稅率有房產(chǎn)稅年稅率和地產(chǎn)稅年稅率，其中：房產(chǎn)稅按標(biāo)準(zhǔn)房價1％；地產(chǎn)稅按標(biāo)準(zhǔn)地價1.5％；標(biāo)準(zhǔn)房價與標(biāo)準(zhǔn)地價不易劃分之城市，暫按標(biāo)準(zhǔn)房地價合并1.5％。應(yīng)納稅額＝標(biāo)準(zhǔn)房價、標(biāo)準(zhǔn)地價或標(biāo)準(zhǔn)房地價合并×適用稅率。實行按年計征，按季或按半年分期繳納方式，其具體方式由主管稅務(wù)機關(guān)決定。
（八）企業(yè)所得稅。計稅依據(jù)為應(yīng)納稅所得額。應(yīng)納稅所得額＝收入總額－準(zhǔn)予扣除項目金額，準(zhǔn)予扣除的項目大致有：成本、費用、稅金、損失。稅率為33％，但稅法又規(guī)定了兩檔照顧性稅率，即對年應(yīng)納稅所得額在3萬元（含3萬元）以下的企業(yè)，暫減按18％的稅率征收企業(yè)所得稅；年應(yīng)納稅所得額在10萬元（含10萬元）以下至3萬元的企業(yè)，暫減按27％的稅率征收企業(yè)所得稅。應(yīng)納所得稅＝應(yīng)納稅所得額×適用稅率。實行按年計算，分月或者分季預(yù)繳，年度終了后4個月內(nèi)匯算清繳，多退少補。
（九）外商投資企業(yè)和外國企業(yè)所得稅。計稅依據(jù)為應(yīng)納稅所得額，應(yīng)納稅所得額＝收入總額－準(zhǔn)予扣除項目金額，準(zhǔn)予扣除的項目大致有：成本、費用、稅金、損失。稅率為30％；地方所得稅稅率為3％。應(yīng)納所得稅＝應(yīng)納稅所得領(lǐng)×（30＋3）％。實行按年計算，分季預(yù)繳，年度終了后4個月內(nèi)匯算清繳，多退少補。
（十）個人所得稅。計稅依據(jù)為應(yīng)納稅所得額。應(yīng)納稅所得額＝收入總額－準(zhǔn)予扣除項目金額，應(yīng)稅所得項目為“個體工商戶的生產(chǎn)、經(jīng)營所得”，準(zhǔn)予扣除的項目大致有：成本、費用（其中投資業(yè)主的工資不予列支）、稅金、損失。適用5％-35％的全年五級超額累進稅率。應(yīng)納所得稅＝應(yīng)納稅所得額×適用稅率－速算扣除數(shù)。稅收政策規(guī)定：個人獨資企業(yè)的投資者以全部生產(chǎn)經(jīng)營所得為應(yīng)納稅所得額；合伙企業(yè)的投資者按照合伙企業(yè)的全部經(jīng)營所得合伙協(xié)議約定的分配比例確定應(yīng)納稅所得額，合伙企業(yè)沒有約定比例的，以全部經(jīng)營所得和合伙人數(shù)量平均計算每個投資者的應(yīng)納稅所得額。
對賬冊健全的個體、個人獨資、合伙醫(yī)療機構(gòu)的經(jīng)營所得應(yīng)納的稅款，實行“查賬征收”方式，按年計算、分月預(yù)繳，年度終了后3個月內(nèi)匯算清繳，多退少補。對賬冊不健全的，實行“核定征收”方式。
一、分類不同，享受的政策不同
按照我國城鎮(zhèn)醫(yī)療衛(wèi)生體制改革的總體部署，所有醫(yī)療機構(gòu)將按照其性質(zhì)、功能和承擔(dān)的任務(wù)不同，分為非營利性醫(yī)療機構(gòu)和營利性醫(yī)療機構(gòu)兩大類。
所謂非營利性醫(yī)療機構(gòu)，是指政府興辦的承擔(dān)基本醫(yī)療服務(wù)并代表地方或者國家水平的醫(yī)療機構(gòu)。以享受政府財政定向補貼為主，不以營利為目的，收入用于醫(yī)療服務(wù)成本，其實際營運中的節(jié)余只能用在自身的發(fā)展上。
所謂營利性醫(yī)療機構(gòu)，是指那些醫(yī)療服務(wù)所得收益可以作為投資者經(jīng)濟回報的醫(yī)療機構(gòu)。其服務(wù)項目可以根據(jù)市場需求自定，并報經(jīng)衛(wèi)生行政部門核準(zhǔn)；醫(yī)療服務(wù)價格實行市場調(diào)節(jié)，自主定價。個體、私營、股份制、股份合作制和中外合資合作的醫(yī)療機構(gòu)一律為營利性醫(yī)療機構(gòu)。
上述非營利性醫(yī)療機構(gòu)和營利性醫(yī)療機構(gòu)均須由衛(wèi)生行政部門核定，并在執(zhí)業(yè)登記中注有“非營利性醫(yī)療機構(gòu)”或“營利性醫(yī)療機構(gòu)”，執(zhí)照方為有效。
（一）關(guān)于非營利性醫(yī)療機構(gòu)的稅收政策
非營利性醫(yī)療機構(gòu)按照國家規(guī)定價格取得的醫(yī)療服務(wù)收入，兔征各項稅收；不按照國家規(guī)定價格取得的醫(yī)療服務(wù)收入，不得享受此項稅收優(yōu)惠政策。優(yōu)惠政策免征的稅收包括：營業(yè)稅、增值稅、企業(yè)所得稅、房產(chǎn)稅、城鎮(zhèn)土地使用稅、車船使用稅等。
但是，非營利性醫(yī)療機構(gòu)從事非醫(yī)療服務(wù)取得的收入，如租賃收入、財產(chǎn)轉(zhuǎn)讓收入、培訓(xùn)收入、對外投資收入等應(yīng)按規(guī)定征收各項稅收；非營利性醫(yī)療機構(gòu)取得的非醫(yī)療服務(wù)收入，直接用于改善醫(yī)療衛(wèi)生服務(wù)條件的部分，經(jīng)稅務(wù)部門審核批準(zhǔn)可抵扣應(yīng)納稅所得額，就余額征收企業(yè)所得稅；非營利性醫(yī)療機構(gòu)的藥房為獨立的藥品零售企業(yè)，應(yīng)按國家規(guī)定征收各項稅收。
（二）關(guān)于營利性醫(yī)療機構(gòu)的稅收政策
營利性醫(yī)療機構(gòu)取得的收入，直接用于改善衛(wèi)生醫(yī)療條件的，自取得執(zhí)業(yè)登記之日起，三年內(nèi)給予下列優(yōu)惠：對取得的醫(yī)療服務(wù)收入免征營業(yè)稅；對其自產(chǎn)自用的制劑免征增值稅；對其機構(gòu)自用的房產(chǎn)、土地、車船免征房產(chǎn)稅、城鎮(zhèn)土地使用稅和車船使用稅。但是，對營利性醫(yī)療機構(gòu)的藥房為獨立的藥品零售企業(yè)，應(yīng)按規(guī)定征收各項稅收。
二、注冊類型、經(jīng)營地點不同，繳納的稅種不同
醫(yī)療機構(gòu)的登記注冊類型，將按國家行政管理部門規(guī)定劃分為三類：第一類為內(nèi)資醫(yī)療機構(gòu)；第二類港、澳、臺商投資醫(yī)療機構(gòu)；三類外商投資醫(yī)療機構(gòu)。目前，我國有關(guān)稅收政策規(guī)定，對注冊類型或經(jīng)營地點不同的醫(yī)療機構(gòu)經(jīng)營應(yīng)稅醫(yī)療服務(wù)項目，繳納的稅種各有不同。
三、稅種不同，計算的方法不同
不同的稅種，由于計稅依據(jù)、稅率不同，所以具體的計算方法也不同。
（一）營業(yè)稅。計稅依據(jù)為醫(yī)療機構(gòu)取得的醫(yī)療服務(wù)收入，稅率5％，應(yīng)納營業(yè)稅額＝醫(yī)療服務(wù)收入×5％。納稅期限分別為5日、10日、15日或一個月；具體期限由主管稅務(wù)機關(guān)根據(jù)應(yīng)納稅額的大小核定；不能按照固定期限納稅的，可以按次納稅。
（二）增值稅。計稅依據(jù)為自產(chǎn)自用制劑的銷售收入。醫(yī)療機構(gòu)屬于不經(jīng)常發(fā)生應(yīng)征增值稅行為的單位，不論其經(jīng)營規(guī)模大小或財務(wù)核算是否健全，均應(yīng)視同小規(guī)模納稅人納稅。適用征收率為6％，應(yīng)納稅額＝自產(chǎn)自用制劑的銷售收入×6％。納稅期限分別為1日、3日、5日、10日、15日或1個月，具體期限由主管稅務(wù)機關(guān)根據(jù)應(yīng)納稅額的大小核定；不能按照固定期限納稅的，可以按次納稅。
（三）城建稅及教育費附加。計稅依據(jù)為應(yīng)繳已繳的營業(yè)稅、增值稅，稅率：城建稅分別是7％（市區(qū)）、5％（縣城鎮(zhèn)）、1％（不在市區(qū)、縣城鎮(zhèn)的）；附加征收率3％。應(yīng)納城建稅及附加＝應(yīng)繳已繳營業(yè)稅、增值稅×（城建稅稅率＋附加征收率）。納稅期限，分別與營業(yè)稅、增值稅納稅期限一致。
（四）印花稅。計稅依據(jù)為經(jīng)濟活動和經(jīng)濟交往中書立、使用、領(lǐng)受具有法律效力的應(yīng)稅憑證的計稅金額或應(yīng)稅憑證件數(shù)。稅率有比例稅率和定額稅率，其中：比例稅率分為5個檔次，分別是0.05‰、0.3‰、0.5‰、1‰、4‰。因具體稅目繁多（11個稅目），故此處省略；定額稅率，“權(quán)利、許可證照”和“營業(yè)賬簿”2個稅目，均按件貼印花稅票，稅額為5元。應(yīng)納稅額＝應(yīng)稅憑證計稅金額（或應(yīng)稅憑證件數(shù)）×適用稅率。實行按次計征，自行貼花、匯貼、匯繳和委托代征的征收方式。
（五）房產(chǎn)稅。計稅依據(jù)是房產(chǎn)的計稅價值（稱之為“從價計征”），房產(chǎn)的計稅價值為房產(chǎn)原值減除10％-30％后的余值，年稅率為1.2％。應(yīng)納稅額＝應(yīng)稅房產(chǎn)原值×（1－扣除比例）×1.2％。實行按年計算，分期繳納的征收方式。
（六）城鎮(zhèn)土地使用稅。計稅依據(jù)是實際占用的土地面積。稅率采用年定額稅率，計量標(biāo)準(zhǔn)為每平方米，具體標(biāo)準(zhǔn)：大城市0.5元至10元；中等城市0.4元至8元；小城市0.3元至6元；縣城、建制鎮(zhèn)、工礦區(qū)0.2元至4元。應(yīng)納稅額＝實際占用應(yīng)稅土地面積（平方米）×適用稅率。實行按年計算，分期繳納的征收方式。
（七）城市房地產(chǎn)稅。計稅依據(jù)為標(biāo)準(zhǔn)房價或標(biāo)準(zhǔn)地價。稅率有房產(chǎn)稅年稅率和地產(chǎn)稅年稅率，其中：房產(chǎn)稅按標(biāo)準(zhǔn)房價1％；地產(chǎn)稅按標(biāo)準(zhǔn)地價1.5％；標(biāo)準(zhǔn)房價與標(biāo)準(zhǔn)地價不易劃分之城市，暫按標(biāo)準(zhǔn)房地價合并1.5％。應(yīng)納稅額＝標(biāo)準(zhǔn)房價、標(biāo)準(zhǔn)地價或標(biāo)準(zhǔn)房地價合并×適用稅率。實行按年計征，按季或按半年分期繳納方式，其具體方式由主管稅務(wù)機關(guān)決定。
（八）企業(yè)所得稅。計稅依據(jù)為應(yīng)納稅所得額。應(yīng)納稅所得額＝收入總額－準(zhǔn)予扣除項目金額，準(zhǔn)予扣除的項目大致有：成本、費用、稅金、損失。稅率為33％，但稅法又規(guī)定了兩檔照顧性稅率，即對年應(yīng)納稅所得額在3萬元（含3萬元）以下的企業(yè)，暫減按18％的稅率征收企業(yè)所得稅；年應(yīng)納稅所得額在10萬元（含10萬元）以下至3萬元的企業(yè)，暫減按27％的稅率征收企業(yè)所得稅。應(yīng)納所得稅＝應(yīng)納稅所得額×適用稅率。實行按年計算，分月或者分季預(yù)繳，年度終了后4個月內(nèi)匯算清繳，多退少補。
（九）外商投資企業(yè)和外國企業(yè)所得稅。計稅依據(jù)為應(yīng)納稅所得額，應(yīng)納稅所得額＝收入總額－準(zhǔn)予扣除項目金額，準(zhǔn)予扣除的項目大致有：成本、費用、稅金、損失。稅率為30％；地方所得稅稅率為3％。應(yīng)納所得稅＝應(yīng)納稅所得領(lǐng)×（30＋3）％。實行按年計算，分季預(yù)繳，年度終了后4個月內(nèi)匯算清繳，多退少補。
（十）個人所得稅。計稅依據(jù)為應(yīng)納稅所得額。應(yīng)納稅所得額＝收入總額－準(zhǔn)予扣除項目金額，應(yīng)稅所得項目為“個體工商戶的生產(chǎn)、經(jīng)營所得”，準(zhǔn)予扣除的項目大致有：成本、費用（其中投資業(yè)主的工資不予列支）、稅金、損失。適用5％-35％的全年五級超額累進稅率。應(yīng)納所得稅＝應(yīng)納稅所得額×適用稅率－速算扣除數(shù)。稅收政策規(guī)定：個人獨資企業(yè)的投資者以全部生產(chǎn)經(jīng)營所得為應(yīng)納稅所得額；合伙企業(yè)的投資者按照合伙企業(yè)的全部經(jīng)營所得合伙協(xié)議約定的分配比例確定應(yīng)納稅所得額，合伙企業(yè)沒有約定比例的，以全部經(jīng)營所得和合伙人數(shù)量平均計算每個投資者的應(yīng)納稅所得額。
對賬冊健全的個體、個人獨資、合伙醫(yī)療機構(gòu)的經(jīng)營所得應(yīng)納的稅款，實行“查賬征收”方式，按年計算、分月預(yù)繳，年度終了后3個月內(nèi)匯算清繳，多退少補。對賬冊不健全的，實行“核定征收”方式。