| 單位名稱 | 單位性質 | 單位地址 | 主要職能 |
| 作物研究所 | 全額撥款事業(yè)單位 | 成都市獅子山路4號 | 農作物遺傳育種、耕作栽培等研究與應用 |
| 植物保護研究所 | 全額撥款事業(yè)單位 | 成都市凈居寺路20號 | 農作物病、蟲、草、鼠防控技術及品種抗性評價等 |
| 生物技術核技術研究所 | 全額撥款事業(yè)單位 | 成都市獅子山路106號 | 農業(yè)生物技術、核技術、農化技術等研究與應用 |
| 遙感應用研究所 | 全額撥款事業(yè)單位 | 成都市凈居寺路20號 | 土地資源調查及農作物的生長監(jiān)測與評估 |
| 農業(yè)信息與農村經濟研究所 | 全額撥款事業(yè)單位 | 成都市凈居寺路20號 | 農業(yè)咨詢、信息資源建設與網絡服務及農村經濟研究 |
| 茶葉研究所 | 全額撥款事業(yè)單位 | 成都市凈居寺路20號 | 茶學科研及應用 |
| 農產品加工研究所 | 全額撥款事業(yè)單位 | 成都市獅子山路4號 | 農產品加工、農業(yè)科研基地管理及服務 |
| 服務中心 | 全額撥款事業(yè)單位 | 成都市凈居寺路20號 | 后勤、幼兒教育等服務 |
| 水稻高粱研究所 | 全額撥款事業(yè)單位 | 瀘州市大驛壩4號 | 水稻、高粱良種良法研究及其推廣應用 |
| 經濟作物育種栽培研究所 | 全額撥款事業(yè)單位 | 簡陽市建設西路21號 | 棉、蔬、藥材等作物品種選育、栽培、植保研究 |
| 蠶業(yè)研究所 | 全額撥款事業(yè)單位 | 南充市儀鳳街108號 | 蠶桑、牧草研究及綜合應用 |
| 院機關監(jiān)察審計處 | 全額撥款事業(yè)單位 | 成都市凈居寺路20號 | 負責全院的黨風、黨紀、監(jiān)督、檢查和行政監(jiān)察審計 |