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2015中國科學(xué)院北京基因組研究所《生物信息學(xué)》考研大綱
《生物信息學(xué)》考試大綱
本《生物信息學(xué)》考試大綱適用于中國科學(xué)院大學(xué)報考生物信息學(xué)專業(yè)的碩士研究生入學(xué)考試。生物信息學(xué)是一門研究生物和生物相關(guān)系統(tǒng)中信息內(nèi)容和信息流向的綜合性科學(xué)。它采用信息科學(xué)、計算機(jī)科學(xué)、生物數(shù)學(xué)、比較生物學(xué)等學(xué)科的觀點和方法對生命的現(xiàn)象及其組成分子(核酸、蛋白質(zhì)等)進(jìn)行研究，主要研究生命中的本質(zhì)和規(guī)律，包括物質(zhì)組成、結(jié)構(gòu)功能、生命體的能量和信息交換傳遞等。通過對生物信息的計算處理，人們能從眾多分散的生物學(xué)觀測數(shù)據(jù)中獲得對生命運行機(jī)制的詳細(xì)而系統(tǒng)的理解。
考試內(nèi)容
★ 生物信息學(xué)概論和數(shù)據(jù)庫
★ 序列數(shù)據(jù)的收集和存儲
★ 基因組序列組裝和基因注釋
★ 基因結(jié)構(gòu)元件識別和分析
★ 雙序列與多序列比對
★ 數(shù)據(jù)庫檢索算法
★ 序列變異研究的算法與進(jìn)化分析
★ 數(shù)據(jù)可視化
★ 基因表達(dá)與調(diào)控網(wǎng)絡(luò)
★ 表觀遺傳學(xué)數(shù)據(jù)分析
★ 蛋白質(zhì)分類與結(jié)構(gòu)預(yù)測
考試要求
★ 了解生物信息學(xué)概念、研究方向、發(fā)展趨勢和重要事件，包括泛基因組和元基因組的概念，第一個全基因組序列和第一個基因組數(shù)據(jù)庫的產(chǎn)生等。
★ 了解重要的生物信息中心和常用數(shù)據(jù)庫(包括DNA序列數(shù)據(jù)庫、基因組數(shù)據(jù)庫、蛋白質(zhì)序列及結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫)
★ 了解不同類型序列數(shù)據(jù)的獲取方式，掌握常用的序列存儲格式及轉(zhuǎn)換方式。
★ 掌握常用序列聯(lián)配算法及軟件，了解打分矩陣及空位罰分算法。
★ 理解多重序列比對與進(jìn)化分析的關(guān)系，掌握常用漸進(jìn)算法及軟件。
★ 掌握FASTA和BLAST系列算法。
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