全校共有十七個學院，例如
藝術學院(College of Fine Arts)、
波士頓大學傳播學院(College of Communication)、
教育學院(School of Education)、
牙醫(yī)學院(Gold man School of Graduate Dentistry)、
工學院(College of Engineering)、
法學院(School of Law)、
文理學院(College of Arts and Science)、
商學院(School of Management)、
醫(yī)學院(School of Medicine)、
大都會學院(Metro politan College)、
公共衛(wèi)生學院(School of Public Health)、
社會工作學院(School of Social Work)
神學院(school of Theology)
酒店管理學院(School of Hospality Adiminstration)
共包括兩百五十個以上不同的科系，為一完整的綜合大學。其中，大都會學院為波士頓大學的一大特色，專為社會人士提供在職進修的機會。