東京大學(xué)校區(qū)設(shè)在東京都內(nèi)文京區(qū)本鄉(xiāng)，占地面積40公頃 ，全校絕大部分機(jī)構(gòu)均在這里。另外在目黑區(qū)駒場(chǎng)另建一新校區(qū)，為教養(yǎng)學(xué)部及部分后勤設(shè)施所在地。附屬學(xué)校、工同研究部門，實(shí)驗(yàn)實(shí)習(xí)基地（如農(nóng)場(chǎng)、林場(chǎng)、地震、火山、天文等觀察站）、師生員工宿舍等分布于全國(guó)各地。原校本區(qū)的舊校門棗紅門所在地，原為江戶時(shí)代藩主迎接家庭成員的地方，大門被漆成朱紅色。后經(jīng)東京大地震和二次大戰(zhàn)的破壞，1949年被國(guó)家定為重點(diǎn)文物。1991年重新修繕一新，十分有氣派，現(xiàn)紅門成為東京大學(xué)的代名詞。
國(guó)內(nèi)高校排名
全球高校網(wǎng)（4ICU）國(guó)家高校排名 第2位
奈杰爾·沃德（Nigelward）日本前30位大學(xué)排名 第1位
全球高校排名
美國(guó)《新聞周刊》世界100強(qiáng)大學(xué)排名 第16位
韋伯麥特里克斯網(wǎng)(Webometrics)世界大學(xué)排名第52位
法國(guó)巴黎高等礦業(yè)學(xué)院世界大學(xué)排名 第1位亞洲排名
QS亞洲大學(xué)排名
| 排名 | 大學(xué)院校 | 國(guó)家或地區(qū) | 得分 |
| 1 | 香港科技大學(xué) | 中國(guó)香港 | 100.00 |
| 2 | 香港大學(xué) | 中國(guó)香港 | 99.80 |
| 3 | 新加坡國(guó)立大學(xué)（NUS） | 新加坡 | 99.30 |
| 4 | 日本東京大學(xué) | 日本 | 97.40 |
| 5 | 香港中文大學(xué) | 中國(guó)香港 | 97.20 |
| 6 | 首爾大學(xué) | 韓國(guó) | 96.90 |
| 7 | 京都大學(xué) | 日本 | 96.30 |
| 8 | 大阪大學(xué) | 日本 | 96.10 |
| 9= | 東北大學(xué) | 日本 | 94.30 |
| 9= | 日本東京工業(yè)大學(xué) | 日本 | 94.30 |
| 11 | 韓國(guó)科學(xué)技術(shù)院 | 韓國(guó) | 94.20 |
| 12 | 浦項(xiàng)科技大學(xué) | 韓國(guó) | 93.60 |
| 13 | 北京大學(xué) | 中國(guó) | 93.30 |
| 14 | 名古屋大學(xué) | 日本 | 92.80 |
| 15 | 香港城市大學(xué) | 中國(guó)香港 | 91.20 |
| 16 | 清華大學(xué) | 中國(guó) | 90.20 |
| 17 | 南洋理工大學(xué)（NTU） | 新加坡 | 89.40 |
| 18= | 九州大學(xué) | 日本 | 86.90 |
| 18= | 延世大學(xué) | 韓國(guó) | 86.90 |
| 20 | 北海道大學(xué) | 日本 | 85.80 |